Estudio Conformacional Exploratorio de un Fragmento de Arabinogalactano Tipo II

BENÍTEZ ELISA INÉS; LOZANO JORGE ENRIQUE; PERUCHENA NÉLIDA MARÍA

San Luis

Congreso; XXV Congreso Argentino de Química; 2006

Asociación Química Argenitna

Desde el punto de vista fisicoquímico, un jugo turbio de manzana es una suspensión coloidal. El medio continuo está conformado por pectina, azúcares y ácido málico. La fase dispersa está mayormente formada por restos celulares provenientes del  procesamiento de la fruta. Para la obtención de jugos de frutas clarificados es necesario realizar un tratamiento enzimático que degrade la pectina presente en el medio continuo, ya que complica el proceso de clarificación. Luego de dicho tratamiento permanecen  en suspensión mayormente  proteínas unidas a arabinogalactano tipo II (AGP), que causan turbiedad al jugo. Con el objetivo de modelar las interacciones entre fragmentos de arabinogalactano II y pequeñas moléculas de solvente y de otros solutos, resulta necesario realizar previamente un estudio conformacional exploratorio en vacío. En este trabajo se parte de un fragmento de Arabinogalactano tipo II, un hexasacárido ramificado, para encontrar la estructura de mínima energía, por mecánica molecular(MM),  que será utilizada en el posterior estudio dinámico utilizando agua como solvente. Los cálculos obtenidos por MM predicen la conformación gL (aa) como la de mínimo global. Se encuentran 5 conformaciones  gL(g+a, ag+, aa, g-g+y g-a ) que difieren en menos de  5 kcal.mol-1, de la de mínima energía. La  conformación gL (g-a)  difiere de la gL (aa) en solo 0.1 kcal.mol-1, por lo que los cálculos de  MM identifican a ambas conformaciones como las estructuras altamente preferidas. Este hecho puede explicarse analizando la capacidad de formar puentes de hidrógeno intramoleculares (intrafragmento). Se encontraron 11 enlaces de hidrógeno. Por medio de la MM se encontró que la estructura de mínima energía corresponde al confórmero gL (aa). Existen además 4 conformeros dentro del mismo grupo que difieren en menos de 5 kcal/mol. Dichas estructuras presentan la particularidad de poder formar  puentes de hidrógeno intramoleculares que le conferirían gran estabilidad al fragmento. Se encontraron 11 puentes de hidrógeno intramoleculares en la estructura de mínima energía. Siendo uno de ellos trifuncional (Ara...GalC) y dos de ellos bifuncional (Ara...GalD y GalC...GalE). Solo 2 corresponden a puentes de hidrógeno fuertes,  el resto involucra a hidrógenos unidos a carbonos en lugar de oxígenos.