LA INTERPRETACIÓN DE DATOS DE NGS PARA ALCANZAR UN DIAGNÓSTICO EN PACIENTES CON DISTROFIA MUSCULAR

CARCIONE, MICAELA;; MAZZANTI, CHIARA; LEONELA LUCE; BOLLANA MACARENA; LLAMES MASSINI CARMEN; VISCONTI TRIANA; FLORENCIA GILIBERTO

Corrientes

Congreso; L CONGRESO ARGENTINO DE GENÉTICA Y II JORNADAS REGIONALES SAG-NEA; 2022

SAG

LA INTERPRETACIÓN DE DATOS DE NGS PARA ALCANZAR UN DIAGNÓSTICO EN PACIENTES CON DISTROFIA MUSCULARCarcione, M.1,2, C. Mazzanti1,2, L. Luce1,2, M. Bollana1,2, C. Llames Massini1,2, T. Visconti1,2, F. Giliberto1,2 .1 Laboratorio de Distrofinopatías, Cátedra de Genética, Facultad de Farmacia y Bioquímica, Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.2 Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo (INIGEM), CONICET - Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.E-mail: mica.carcione@gmail.comLas distrofias musculares (DM) son un conjunto de enfermedades hereditarias poco frecuentes que ocasionan debilidad y degeneración progresiva del músculo esquelético. Las DM más frecuentes son las distrofinopatías, causadas por alteraciones moleculares en el gen DMD. Por el solapamiento de síntomas con otras DM, en los casos donde no se encuentra la alteración en el gen DMD podría estar afectado otro gen asociado a DM. El objetivo fue alcanzar un diagnóstico diferencial en pacientes con DM con el fin de poder establecer el estándar de cuidado. Se analizaron 191 pacientes con diagnóstico clínico presuntivo de distrofinopatía mediante secuenciación de exoma completo (WES). Se utilizaron programas bioinformáticos y herramientas de modelado molecular. Se halló la variante de secuencia causante de patología en el gen DMD en 149 de los pacientes analizados, alcanzando una tasa de detección del 78%. Ciertas variantes fueron analizadas con programas bioinformáticos y se realizó modelado de las proteínas para establecer su patogenicidad. Se encontraron errores en el llamado de algunas variantes al analizar los datos crudos de WES. Se aumentó la tasa de detección de alteraciones moleculares al 92% al analizar otros genes asociados a DM. Finalmente, este trabajo demostró distintas estrategias para uno de los mayores desafíos en la interpretación de datos de WES que es la validación del efecto patogénico de variantes, resaltó la importancia del análisis de datos crudos de WES y permitió caracterizar con una alta tasa de detección la población argentina afectada con DM.