INIAB   27336
INSTITUTO DE INVESTIGACIONES AGROBIOTECNOLOGICAS
Unidad Ejecutora - UE
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- Análisis bioinformático sobre la información suministrada por el contratante para programas de mejoramiento genético de cultivos(ST 5406)[+]Detalle STANSelección asistida por marcadores y selección genómica para mejorar la toma de decisiones; procesamiento de bases de datos de marcadores moleculares, preparación de archivos para software específico de análisis, análisis estadístico y genético poblacional; asociación de datos fenotípicos y genotípicos e identificación de genes de interés. Destinatarios: instituciones públicas o privadas con programas de mejoramiento genético vegetal.MetodologíaEn una primera etapa, luego de conocer los objetivos a corto, mediano y largo plazo del usuario, se analizan los datos fenotípicos y genotípicos disponibles. Una vez identificados los caracteres de mayor interés a corto plazo se procede a identificar marcadores moleculares asociados a estos mediante mapeo de QTL en poblaciones biparentales o estudios de asociación de genoma amplio (GWAS). Los marcadores asociados a caracteres de interés permiten identificar genes candidatos, así como también eficientizar programas de mejoramiento genético vegetal mediante selección asistida por marcadores y/o selección genómica. Al finalizar el servicio se entregará al usuario un informe detallado de los resultados obtenidos.EquipamientoPC con capacidad para analizar gran volumen de datos. Intel I5-8400Disciplina PrimariaCiencias AgrariasDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-GENETICA (BIOGENETICA)Campo de AplicaciónProduccion vegetal-SemillasActividad IndustrialProducción de semillas varietales o autofecundadas de cereales, oleaginosas, y forrajerasPalabras Claveanálisis bioinformático
identificación de QTL
marcadores moleculares
selección asistida
selección genómica
- Análisis y cuantificación de fitohormonas y otros bioactivos (flavonoides y ácidos orgánicos) en muestras sólidas y líquidas de tejidos vegetales, suelos y formulaciones bacterianas (bioinsumos) provistas por el contratante.(ST 5960)[+]Detalle STANLas fitohormonas y otros compuestos bioactivos constituyen un amplio grupo de moléculas regulando procesos en el crecimiento y desarrollo. Su cuantificación y análisis por LC-MS-MS revela que son producidos por plantas, hongos y bacterias, brindando valiosa información para comprender las respuestas a nivel de la promoción y desarrollo vegetal bajo condiciones favorables o desfavorables, conocer los efectos alelopáticos entre organismos y su importancia en la interacción planta-microorganismo.MetodologíaLa caracterización de fitohormonas (ABA, JA, SA, IAA, Z, Ki y GA3) y otros compuestos bioactivos de interés, que se soliciten, se realizará mediante cromatografía líquida (LC) y detección de su masa (MS-MS). Dependiendo de la muestra del servicio provista por el contratante, una parte de la muestra se mezclará con buffer de extracción a pH 2,8-3. Como estándar interno se agregará 50 ng de cada hormona en su forma deuterada. Se dejará equilibrar la muestra con el estándar. Luego de centrifugar y transferir el sobrenadante a otro tubo, se agregará igual cantidad de acetato de etilo y se someterá a evaporación total de la fase orgánica. Esta fase se retomará con MeOH (100%) y se purificará mediante filtros. Se recolectará en eppendorf, se llevará a sequedad total, los extractos se retomarán y se colocarán en viales específicos conteniendo insertos de 150 ?l de capacidad, inyectando en el equipo una alícuota de 10 ?l de cada muestra. Las corridas cromatográficas se realizarán en un cromatógrafo líquido LC Alliance (Waters 2695) con autoinyección y detector de UV, acoplado a un espectrómetro de masas tándem (MS-MS) Micromass Quattro Ulttima Pt, monitoreado mediante el Software MassLynx V4.1. Los cálculos del contenido de fitohormonas se realizarán teniendo en cuenta el área del estándar, el pico de la muestra y su volumen o peso.EquipamientoCromatografo líquida de alta eficiencia (HPLC) HPLC Waters e2695Disciplina PrimariaCiencias AgrariasDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-BIOQUIMICACampo de AplicaciónVarios camposActividad IndustrialServicios de publicidadPalabras Clavefitohormonas
compuestos bioactivos
espectrometría de masas
plantas
cultivos bacterianos
- Recuento de bacterias en ensayos de inoculación de plantas en microcosmos (ST 6046)[+]Detalle STANEl recuento de bacterias en diferentes órganos de la planta y en sustratos empleados en ensayos en microcosmos revela la cantidad de bacterias que se encuentran en los mismos. Estos datos brindan información sobre la carga bacteriana total o de poblaciones bacterianas específicas que se encuentran en los tejidos y/o sustratos a analizar. Destinatarios: instituciones que trabajen en área de estudio, empresas de inoculantes y afines que proveerán los órganos de plantas y sustratos para el servicioMetodologíaRecuento de bacterias en diferentes órganos de la planta y en sustratos empleados en ensayos en microcosmos. El recuento de bacterias epífitas (externas) o endófitas (interior) de tejidos de la planta se realizará separando tallos, hojas y raíces, dependiendo de lo que se desee analizar. Las bacterias epífitas se determinarán colocando 3 gr del tejido a analizar en frascos erlenmeyer de 500 ml conteniendo 25 gr de perlas de vidrio y 50 ml de solución fisiológica. Los frascos serán agitados a 150 rpm a la temperatura adecuada durante una hora. Se realizarán diluciones seriadas y serán sembradas en placas de Petri conteniendo el medio correspondiente, según lo que se desee analizar. Para el recuento de bacterias rizosféricas o bacterias en el sustrato. Se tomarán 0,5 g de muestra de suelo que serán resuspendido en 4,5 ml de pirofosfato de sodio 0.1% estéril. Se realizarán diluciones seriadas que serán sembradas en placas de Petri conteniendo el medio correspondiente. Cuando se requiera hacer un seguimiento de la bacteria inoculada, primeramente, se hará un perfil de resistencia a antibióticos de dicha cepa y se harán comparaciones de material genético (ERIC/BOX-PCR) entre las bacterias recuperadas en los tejidos o sustratos a analizar y la cepa inoculada. Se entregará un informe con resultados.EquipamientoCampana de seguridad tipo II Heal Force HF Safe 1200 | Agitador orbital Marca: Biomint Fabricación Propia BM021Disciplina PrimariaCiencias AgrariasDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-MICROBIOLOGIACampo de AplicaciónProduccion vegetalActividad IndustrialInvestigación y desarrollo experimental en el campo de la ingeniería y de las ciencias exactas y naturalesPalabras Clavebacterias
inoculantes biológicos
viabilidad
plantas
ensayos en microcosmos
- Determinación de hormonas vegetales en tejidos de plantas, semillas, insectos y microorganismos provistos por el contratante.(ST 6000)[+]Detalle STANEl servicio consta en determinar metabolitos vegetales con actividad hormonal, que no solo se encuentran en plantas, también en insectos que están en contacto con plantas y microorganismos que los usan para comunicarse con las plantas. Entre familias hormonales encontramos Auxinas, Giberelinas, Citocininas, Jasmonatos, Ácido Abscisico-Salicílico. Las muestras son provistas por el contratante. Destinatarios: sistema científico-tecnológico y empresas que elaboran bioinsumos para el sector agrícolaMetodologíaConsiste en la extracción de las hormonas del material, el cual en caso de ser tejido vegetal o de insectos (provisto por el contratante), en lo posible, debe ser entregado liofilizado, o en el caso de cultivos bacteriano, en medio liquido. Para la extracción se utiliza agua bidestilada y deionizada y luego se realiza una partición liquido-liquido con eter etílico, recuperándose la fracción orgánica, donde se encuentran los ácidos débiles, que es donde se encuentran las hormonas que se determinan al ser las mismas ácidos débiles. El servicio implica la recepción de muestras por parte del comitente, las cuales podrían requerir permisos.EquipamientoCromatógrafo líquido de ultra alta performance acoplado a espectrómetro de masas HPLC Waters Acquity H-Class / Xevo TQ-S MicroDisciplina PrimariaCiencias AgrariasDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-BIOQUIMICACampo de AplicaciónOtros camposActividad IndustrialInvestigación y desarrollo experimental en el campo de la ingeniería y de las ciencias exactas y naturalesPalabras Clavehormonas vegetales
auxinas
giberelinas
ácido abscisico
ácido jasmónico
- Asesoramiento en el análisis bioinformático para programas de mejoramiento genético de cultivos(ST 6317)[+]Detalle STANEl asesoramiento contempla: selección asistida por marcadores y selección genómica para mejorar la toma de decisiones; procesamiento de bases de datos de marcadores moleculares, preparación de archivos para software específico de análisis, análisis estadístico y genético poblacional; asociación de datos fenotípicos y genotípicos e identificación de genes de interés. Destinatarios: instituciones públicas o privadas con programas de mejoramiento genético vegetal.MetodologíaEn una primera etapa, luego de conocer los objetivos a corto, mediano y largo plazo del usuario, se analizan los datos fenotípicos y genotípicos disponibles. Una vez identificados los caracteres de mayor interés a corto plazo se procede a brindar asesoramiento en la identificación de marcadores moleculares asociados a estos caracteres mediante mapeo de QTL en poblaciones biparentales o estudios de asociación de genoma amplio (GWAS). Los marcadores asociados a caracteres de interés permiten identificar genes candidatos, así como también eficientizar programas de mejoramiento genético vegetal mediante selección asistida por marcadores y/o selección genómica.EquipamientoPC con capacidad para analizar gran volumen de datos. Intel I5-8400Disciplina PrimariaCiencias AgrariasDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-GENETICA (BIOGENETICA)Campo de AplicaciónProduccion vegetal-SemillasActividad IndustrialProducción de semillas varietales o autofecundadas de cereales, oleaginosas, y forrajerasPalabras Claveanálisis bioinformático
identificación de QTL
marcadores moleculares
selección asistida
selección genómica