IDENTIFICACIÓN IN SÍLICO DE NUEVAS REGIONES GENÓMICAS ASOCIADAS AL CARÁCTER TIPO DE CARPELO EN FRUTOS DE TOMATE (S. lycopersicum)

PEREIRA DA COSTA, J. H.; VAZQUEZ, D.V.; RODRÍGUEZ, G.R.; CAMBIASO, V.

Mendoza

Congreso; Asociación Latinoamericana de Genética; 2019

Sociedad Argentina de Genética

Existe una gran diversidad para la forma de fruto en el tomate cultivado y es un carácter de gran importancia económica. Nuevas versiones del genoma de referencia en tomate y metodologías de análisis in sílico, proveen herramientas para reanalizar la información existente y obtener resultados inéditos. A partir de un cruzamiento intravarietal, se realizó un análisis de grupos discrepantes y secuenciación de genoma completo, para detectar regiones genómicas asociadas al carácter tipo de carpelo (TC, fusionado o no fusionado). Se identificó una región en la base del cromosoma 6 asociada al carácter. Un análisis posterior de TC en la generación F2 y las retrocruzas de la F1 hacia ambos parentales mostró que las frecuencias observadas se ajustan a la segregación esperada para una epistasis doble recesiva. El objetivo fue identificar regiones genómicas asociadas a la segregación de TC mediante nuevas aproximaciones metodológicas bioinformáticas para explicar su herencia. Las secuencias genómicas de los grupos discrepantes se alinearon a la versión SL3.0 del genoma de referenciade tomate y se compararon. Se identificaron los polimorfismos genómicos asociados al carácter mediante la metodología G ́ utilizando el paquete QTLseqr de R. Se logró identificar un nuevo QTL putativo de 59Mb de longitud en la región centromética del cromosoma 10 (p