Diversidad genética de suelo y esporas de hongos micorrícicos nativos de Buenos Aires

THOUGNON ISLAS, AJ; COVACEVICH, F; HERNANDEZ GUIJARRO, K

Bahia Blanca

Congreso; XXIV Congreso Argentino de la Ciencia del Suelo; 2014

AACS

El objetivo de este trabajo fue, a partir de muestras de suelo provenientes sitios de aptitud agrícola de la provincia de Buenos Aires con manejo contrastante, evaluar la eficiencia de un kit comercial de extracción de ADN utilizado a partir de suelo y de esporas determinando el relevamiento de la diversidad genética de hongos micorrícicos arbusculares (HMA) de cada método. Se seleccionaron 7 localidades de la provincia de Buenos Aires, cada una bajo manejo agrícola y prístino. Los HMA fueron multiplicados mediante plantas trampa, se determinó la capacidad micotrófica (MA), la abundancia de esporas y se realizó la extracción de ADN tanto del suelo como de las esporas colectadas utilizando el kit ZR Soil Microbe DNA MiniPrepTM. Para la extracción a partir de esporas el protocolo fue modificado macerando las esporas con un micropistilo estéril en el primer buffer de extracción del protocolo. Se cuantifico el contenido y calidad del ADN extraído y se realizó la estrategia de nested PCR para luego realizar geles SSCP, a partir de los cuales se obtuvieron patrones de bandas con los que se realizaron dendrogramas de similitud y se calculó el Índice de diversidad de Shannon-Weaver (H) y el Índice de diversidad de Simpson (D). El MA (%) varió de 4,8% a 56,7% entre localidades, mientras que la abundancia de esporas registró valores que se mantuvieron dentro del rango de 80-1175 esporas 100 g suelo-1. El dendrograma de similitud construído a partir de los patrones SSCP de las muestras de ADN de suelo, no mostró un patrón de agrupación mientras que el obtenido a partir del ADN extraído de esporas, agrupó a las muestras en tres Clusters (los dos primeros contenían dos localidades cada uno mientras que el tercer Cluster agrupó tres localidades) y dentro de cada Cluster, se encontraron ambos manejos de la misma localidad. Para el Índice H, los valores obtenidos a partir de suelo fueron mayores que los de esporas, registrando valores medios de 2,71 para las muestras de suelo y valores de 1,44 para las provenientes de esporas. En el Índice D, tanto las muestras provenientes de suelo como las de esporas presentaron altos valores de diversidad y los índices fueron semejantes y próximos a 0,9. El Análisis de Componentes Principales (PCA) permitió separar los sitios de estudio según su manejo y explicó el 80,5% de la variabilidad total en las dos primeras componentes. Se evidenció asociación negativa entre el MA con el P-Bray y entre el número de esporas con el contenido de Fe. Los índices de diversidad se agruparon juntos, independientemente si fueron calculados a partir de ADN de suelo o de esporas, mostrando una asociación negativa con el contenido de P-Bray. La modificación del protocolo de extracción de ADN a partir de esporas no mostró mayor diversidad de acuerdo a los índices calculados y en el PCA se observó que los índices se comportaron igual, por lo que será necesario entonces confirmar los resultados obtenidos mediante el secuenciamiento de las muestras.