Genetic diversity of Fusarium graminearum sensu lato isolates obtained from wheat associated

CONSOLO VF; LEONEL ORTEGA; GRACIELA SALERNO; ANDREA ASTORECA; ALCONADA MT

REVISTA ARGENTINA DE MICROBIOLOGíA

Elsevier España

Lugar: Buenos Aires; Año: 2015 vol. 47 p. 245 - 250

0325-7541

Abstract: Fusarium Head Blight is an important wheat disease in Argentina Pampas region, being Fusarium graminearum the predominant pathogen. DNA polymorphism of the isolates was studied by (IGS)-RFLP and ISSR. IGS-RFLP and ISSR profiling were carried out using six endonucleases and eight primers, respectively. IGS-RFLP yielded 41 bands being 30 polymorphic while ISSR produced 87 bands with 47 polymorphic bands. Both markers has shown genetic variability among the analyzed isolates, however IGS-RFLP was more efficient than ISSR with higher polymorphism average (59.91%) than the second (44.11%). The averages of polymorphism information content (PIC) value were 0.211 and 0.129, respectively. Twenty haplotypes were identified by IGS-RFLP and 15 haplotypes by ISSR. Clustering of genotypes within dendrograms was different for both types of markers. The genetic groups obtained showed a partial association to geographic origin. This is the first report on genetic variability using IGS-RFLP and ISSR markers of F. graminearum isolates from wheat in Argentina.La fusariosis de la espiga de trigo es una importante enfermedad para la región pampeana Argentina, siendo Fusarium graminearum el principal patógeno asociado. El polimorfismo del ADN de los aislamientos fue estudiado utilizando (IGS)-RFLP y (ISSR). IGS- RFLP produjo 41 bandas, siendo 30 polimórficas, mientras los ISSR produjeron 87 bandas con 47 bandas polimórficas. IGS- RFLP fue más eficiente que ISSR, ya que el primero detectó mayor promedio polimórfico (59,91%) que el segundo (44,11%). Los valores promedio del contenido de información polimórfica (PIC) fueron 0.211 y 0.129, respectivamente. Se identificaron 20 haplotipos por IGS- RFLP mientras que ISSR reveló 15 haplotipos. La agrupación de genotipos obtenida para ambos dendogramas fue diferente. Los grupos genéticos obtenidos mostraron una asociación parcial con el origen geográfico. Este es el primer reporte que analiza la variabilidad genética en poblaciones de F. graminearum de trigo empleando marcadores RFLP e ISSR en Argentina. Abstract: Fusarium Head Blight is an important wheat disease in Argentina Pampas region, being Fusarium graminearum the predominant pathogen. DNA polymorphism of the isolates was studied by (IGS)-RFLP and ISSR. IGS-RFLP and ISSR profiling were carried out using six endonucleases and eight primers, respectively. IGS-RFLP yielded 41 bands being 30 polymorphic while ISSR produced 87 bands with 47 polymorphic bands. Both markers has shown genetic variability among the analyzed isolates, however IGS-RFLP was more efficient than ISSR with higher polymorphism average (59.91%) than the second (44.11%). The averages of polymorphism information content (PIC) value were 0.211 and 0.129, respectively. Twenty haplotypes were identified by IGS-RFLP and 15 haplotypes by ISSR. Clustering of genotypes within dendrograms was different for both types of markers. The genetic groups obtained showed a partial association to geographic origin. This is the first report on genetic variability using IGS-RFLP and ISSR markers of F. graminearum isolates from wheat in Argentina.La fusariosis de la espiga de trigo es una importante enfermedad para la región pampeana Argentina, siendo Fusarium graminearum el principal patógeno asociado. El polimorfismo del ADN de los aislamientos fue estudiado utilizando (IGS)-RFLP y (ISSR). IGS- RFLP produjo 41 bandas, siendo 30 polimórficas, mientras los ISSR produjeron 87 bandas con 47 bandas polimórficas. IGS- RFLP fue más eficiente que ISSR, ya que el primero detectó mayor promedio polimórfico (59,91%) que el segundo (44,11%). Los valores promedio del contenido de información polimórfica (PIC) fueron 0.211 y 0.129, respectivamente. Se identificaron 20 haplotipos por IGS- RFLP mientras que ISSR reveló 15 haplotipos. La agrupación de genotipos obtenida para ambos dendogramas fue diferente. Los grupos genéticos obtenidos mostraron una asociación parcial con el origen geográfico. Este es el primer reporte que analiza la variabilidad genética en poblaciones de F. graminearum de trigo empleando marcadores RFLP e ISSR en Argentina.