Análisis de la respuesta a estrés oxidativo a bajas tensiones de oxígeno en Pseudomonas extremaustralis: un enfoque transcriptómico.

TRIBELLI, P.M.; MOLIN, S.; RICARDI,M.M.; LÓPEZ, N.I.; SOLAR VENERO, E.C.; GOMEZ-LOZANO M.

Congreso; XXIII Congreso Latinoamericano de Microbiología (ALAM); 2016

Análisis de la respuesta a estrés oxidativo a bajas tensiones de oxígeno en Pseudomonas extremaustralis: un enfoque transcriptómico1.EC Solar Venero12.PM Tribelli123.MM Ricardi34.M Gómez Lozano45.S Molin46.NI López121.1 IQUIBICEN, CONICET, Argentina2.2 Dpto. QB, FCEyN, UBA, Argentina3.3 IFIBYNE-CONICET, Argentina4.4 Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability DTU, DenmarkLa disponibilidad de O2 es un factor clave en el desarrollo y supervivencia bacteriana. Como bien se sabe, en ausencia de O2 algunas especies de Pseudomonas pueden utilizar NO3- como aceptor de e- o fermentar arginina o piruvato. Asimismo, en la naturaleza se producen especies reactivas de oxigeno (ROS) que resultan dañinas. Estas pueden derivar tanto del metabolismo bacteriano como de la incidencia de luz UV, las bajas temperaturas o la presencia de compuestos químicos contaminantes y antibióticos. A su vez, las ROS pueden generar especies reactivas de nitrógeno (RNS) al reaccionar con los compuestos derivados de la reducción del NO3-.Las respuestas genéticas que permiten hacer frente a ROS y RNS en microaerobiosis han sido poco estudiadas. Dado que estas condiciones se encuentran frecuentemente en la naturaleza, el objetivo del trabajo consistió en evaluar la respuesta celular al estrés nitro-oxidativo en bajas tensiones de O2 mediante la utilización de técnicas globales.Se analizó la supervivencia por recuento de células viables y se obtuvieron los datos de transcriptómica por secuenciación masiva de RNA (RNA-Seq) en condiciones de cultivo microaeróbicas con KNO3 sin estrés y expuestos a H2O2 3mM. Se utilizó el programa Rockhopper para determinar los genes con expresión diferencial. Se asignaron categorías funcionales utilizando los programas Blast2GO, MetaCyc y KEGG. La validación de los datos de RNA-Seq se realizó por RT qPCR. Se evaluó el estado redox celular antes y después de la exposición a estrés, determinándose la relación NADH/NAD+.La exposición al estrés provocó una caída en la supervivencia y una menor relación NADH/NAD+ (P