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Lìquenes del género Punctelia fueron muestreadas en el área del complejo volcánico Farallón Negro, con el fin de obtener datos ecológicos y químicos de este género que luego será evaluado como posible biomonitor de calidad de aire en el área minera. Para ello se tomaron nuestras en dos cuencas (arroyo Potreros y arroyo Vis-Vis), en sitios con distinta altitud y a partir de dos tipos de sustratos. En los talos se analizó el contenido de pigmentos fotosintéticos (clorofilas, feofitinas y carotenoides) y polifenoles solubles totales, que son parámetros utilizados como biomarcadores de calidad ambiental en líquenes. Punctelia es un género de hongos liquenizados frecuente en el área de estudio. Las especies representativas de ambas cuencas son P. microsticta, P. punctilla y P. stictica. Sin embargo, en la cuenca del arroyo Potreros, P. microsticta y P. stictica son más frecuentes y con mayores valores de cobertura que P. punctilla, la cual es más abundante en la cuenca del arroyo Vis-Vis.Del análisis de los biomarcadores se observan diferencias significativas entre sitios para ambas cuencas, los cuales responden a parámetros ecológicos como sustrato, altura y exposición a la radiación solar. Los pigmentos fotosintéticos correlacionan negativamente con polifenoles solubles totales. De los parámetros analizados, clorofilas a, clorofila total, feofitina a y feofitina total son los que mejor explican la variabilidad de los datos. Estos serían, por tanto, parámetros de elección para realizar futuros estudios de Punctelia como bioindicador. No obstante, dado que estos parámetros responden a diversas variables ambientales, las mismas deberán tenerse en cuenta al ajustar el diseño muestral cuando se estudie la respuesta de este género a calidad de aire en el área minera.