Análisis bioinformático de los sistemas regulatorios del rizobio ácido tolerante Rhizobium favelukesii

PISTORIO, MARIANO; NILSSON, JULIET F.; SARMIENTO, LOLA

Conferencia; XXX Reunión Latinoamericana de Rizobiología V Conferencia Latinoamericana de Microorganismos Promotores del Crecimiento Vegetal; 2021

La alfalfa es una leguminosa forrajera de gran relevancia, y su asociación simbiótica con el rizobio eficiente, Ensifer (Sinorhizobium) meliloti, se ve afectada en suelos ácidos principalmente debido a la baja tolerancia a la acidez por parte de este rizobio. Hace algunos años se aisló un rizobio ácido-tolerante recientemente denominado Rizhobium Favelukesii, que es muy competitivo para la nodulación de alfalfa pero ineficiente en la fijación biológica de nitrógeno. Estas características, más parasíticas que simbióticas, lo convierten en un potencial factor riesgo en suelos agrícolas donde coexiste y compite con E. meliloti. Estudios transcriptómicos demostraron que R. favelukesii comparte parte de la respuesta al estrés ácido con el rizobio ácido-sensible E. meliloti, sin embargo, los perfiles de expresión de un gran número de genes no son coincidentes entre las respuestas de ambos rizobios. Que la mayoría de los genes expresados diferencialmente estén presentes en ambos genomas conduce a la hipótesis de que la diferencia entre un fenotipo ácido-sensible y uno ácido-tolerante puede recaer principalmente en los patrones espacio-temporales de expresión de ambos rizobios frente al mismo estrés. En este contexto, en este trabajo se realizó un análisis bioinformático global de los sistemas regulatorios de R. favelukesii, y en particular de aquellos posiblemente asociados al fenotipo ácido tolerante. Se identificaron y caracterizaron 666 reguladores transcripcionales presentes en el genoma de R. favelukesii LPU83, que incluyen factores sigma, sistemas de dos componentes y sistemas de un componente. La clasificación de los mismos en familias mostró perfiles similares en cuanto a distribución y cantidades en relación a los previamente descriptos para rizobios relacionados. A su vez, a partir de un análisis predictivo de los sitios de unión a factores de transcripción, se encontraron varios motivos que surgen como potenciales sitios de unión involucrados en la respuesta de R. favelukesii frente al estrés ácido.