Selección de biomarcadores epigenéticos en carcinomas mamarios humanos

EMANUEL CAMPOY; FEDERICO FORCHINO; RODRIGO MILITELLO

Mendoza

Jornada; V JORNADAS DE INVESTIGACIÓN DE ACES, JORNADAS DE HIPERTENSIÓN ARTERIAL DE CUYO; 2020

Según el Observatorio Global de Cáncer de la OMS, el cáncer de mama fue el de mayor incidencia con más de 21.000 casos en 2018, representando el 17% de todos los tumores malignos y casi un tercio del cáncer en mujeres. El proceso tumorigénico se caracteriza por la adquisición de alteraciones genéticas y epigenéticas a lo largo del tiempo. La hipermetilación aberrante de genes supresores de tumores es un fenómeno que forma parte de la tumorigénesis mamaria y se evidencia desde estadios tumorales tempranos. Nuestra hipótesis señala que la hipermetilación de sitios especificos en el ADN de carcinomas mamarios humanos permite definir blomarcadores epigenéticos diagnósticos y pronósticos. En función de los avances tecnológicos en las ciencias biomédicas, en la actualidad es posible utilizar bases de datos públicas que alojan información genética, epigenética y clinico-patológica de un gran repertorio de tumores humanos. Estas bases de datos han sido procesadas con herramientas bioinformáticas estableciendo algoritmos de normalización y harmonización de las variables constituyendo una fuente actualizada y prácticamente inagotable de información. Con la finalidad de verificar nuestra hipótesis, en esta primera etapa del proyecto, diseñamos una estrategia basada en el desarrollo de un algoritmo de selección de biomarcadores epigenéticos a partir de estas bases de datos. De esta manera a partir de 450.000 sitios de metilación obtuvimos un panel de sitios candidatos especificos. El algoritmo de selección contempló la aplicación de fórmulas matemáticas (deltas de medianas de metilación), criterios biológicos (correlación con expresión génica), clínicos (sobrevida de pacientes en función de la expresión génica) y aspectos metodológicos (factibilidad de ser estudiados por PCR metil especifica) que nos permitió finalmente seleccionar 6 sitios candidatos especificos. El próximo paso será testear los candidatos en ADN extraído de carcinomas mamarios de la región para finalmente intentar contribuir con una medicina personalizada de precisión.