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Las amebas de vida libre (AVL) son protozoos cosmopolitas que se encuentran en suelo, agua y aire. Existen cuatro géneros: Naegleria, Acanthamoeba, Balamuthia y Sappinia, que incluyen especies patógenas para el hombre. El objetivo del presente trabajo fue la búsqueda, aislamiento y caracterización de protozoos del género Acanthamoeba y Naegleria en una piscina semicubierta de un complejo termal, en la ribera del río Salado de la provincia de Buenos Aires. Se estudiaron 2 muestras de fondo, 2 de superficie, y 1 de la boca del pozo del agua termal. Se midieron temperatura, concentración salina y pH. Las muestras se analizaron por observación directa y por cultivo en agar no nutritivo cubierto con una capa de Escherichia coli, incubando a 37 °C y 42 °C. La identificación de género se realizó de acuerdo a la morfología de las formas evolutivas. Para identificar especies del género Naegleria se efectuó además la prueba de transformación ameboflagelar en un medio de baja fuerza iónica. Los valores de sólidos disueltos totales y conductividad eléctrica del agua termal fueron 43.360 mg/l y 64.900 uS/cm, respectivamente. En las observaciones microscópicasdirectas no se hallaron elementos parasitarios y por cultivo, se aislaron AVL solo en las 2 muestras del fondo del pozo. La prueba de transformación ameboflagelar resultó negativa. Se observó crecimiento de trofozoítos en el cultivo, que podrían corresponder morfológicamente al género Acanthamoeba. La ausencia de ejemplares del género Naegleria podría relacionarse con la alta concentración salina detectada en el agua termal. Si bien no se ha podido establecer la especie aislada, los hallazgos evidencian condiciones favorables de crecimiento de AVL en un medio de alta concurrencia humana, por lo que es necesario estar alerta, conociendo además las dificultades en la eliminación de las mismas con los agentes microbicidas más comunes.