EVALUACIÓN DE MARCADORES GENÉTICOS MEDIANTE ANÁLISIS IN SILICO PARA DETERMINAR ESPECIES DEL ORDEN PLAGIORCHIIDA (TREMATODA: DIGENEA)

DORA DAVIES; HÉCTOR A. CRISTÓBAL; JOSÉ D. SARAVIA

Catamarca

Congreso; 46° Congreso Argentino de Genetica; 2017

El orden Plagiorchiida es un grupo complejo dentro de los trematodes, en el que muchas veces la morfología es insuficiente para la determinación de especies. Las técnicas moleculares mejoran las posibilidades de discriminación entre especies; actualmente se emplean marcadores genéticos para, entre otras aplicaciones, distinguir entre especies cripticas o realizar estudios filogenéticos.El objetivo del trabajo fue evaluar cebadores, publicados y diseñados, para el operón ribosomal (ADNr) y citocromo oxidasa subunidad 1 (COI) que permiten la determinación de géneros y especies del orden Plagiorchiida.Para ello se utilizaron herramientas bioinformáticas, tales como el Primer-Blast y DNA-MAN, para analizar 5 juegos de cebadores para COI y 8 juegos para ADNr. Los mismos fueron obtenidos de bibliografía y cebadores para ambos marcadores fueron diseñados a partir de un múltiple alineamiento de secuencias publicadas en la base de datos del NCBI.Los resultados in silico muestran que los sistemas que amplificaron productos de mayor tamaño (2792 pb) fueron BD1F y JS2R para ADNr con la detección de 49 especies; y el sistema PJ2COIF y 10030R para COI (2149 pb.) que identifica 10 especies. Los sistemas JB10F y JB9R que amplifica 304 pb para ADNr detecta 79 especies de interés; por otro lado, el set JB3F y JB4.5R amplifica 444 pb. para COI identificando 15 especies. Por lo tanto, los sistemas más prometedores fueron BD1F - JS2R y PJ2COIF ? 10030R. La evaluación bioinformática de marcadores genéticos establece las bases para un posterior análisis filogenético en parásitos del Orden Plagiorchiida.