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Es muy importante proveer a la población agua segura para el consumo y así disminuir la trasmisión de enfermedades através de la misma. Para ello se utilizan biocidas para la desinfección. Un método bien desarrollado y estudiado es el de la aplicación de luz UV. La radiación UV afecta directamente el material genético de las células. Su principal efecto es la formación de dímeros de timina. Un método muy utilizado para el estudio del ADN es la amplificación en cadena de la polimerasa (PCR). En este trabajo utilizamos una técnica denominada ERIC-PCR para establecer su utilidad en la detección del daño producido por la radiación UV-C hacia dos indicadores bacterianos de calidad de agua: Escherichia coli y Pseudomonas aeruginosa. Para ello se hicieron corridas experimentales en un reactor batch anular de 2 L, con una lámpara UV-C (Philips, 15w) en el centro. Se realizaron diferentes experiencias con dos intensidades diferentes de radiación. Los experimentos consistieron en irradiar con UVC la suspensión de trabajo cuya concentración fue de 107 UFC/cm3 de microorganismos. Se tomaron muestras a distintos tiempos. Posteriormente las muestras fueron sembradas en medios de cultivo sólido para determinar la concentración de microorganismos viables. A continuación, se procedió con las extracciones de ADN para su estudio. Para ambos microrganismos los procesos de desinfección mediante UV fueron muy efectivos alcanzándose un 99,99% de inactivación en el rango de los 12 a 30 segundos para todas las condiciones estudiadas. Por otra parte, a partir de los resultados de los geles de ERIC-PCR, evidenciamos que el daño se presentó como la desaparición de las bandas de mayor tamaño molecular para ambas cepas estudiadas. Nuestros resultados indican que la técnica de ERIC-PCR es útil para detectar el daño global al ADN proporcionando información sobre el mecanismo de acción intrínseco de la desinfección por UV-C.