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El desarrollo económico y social en los últimos años ha llevado a nuevos paradigmas en las organizaciones, especialmente en las empresas de base tecnológica orientadas a la innovación. En este contexto, surge el concepto de organizaciones fractales basadas en proyectos, donde se establecen alianzas estratégicas entre diferentes organizaciones que se reúnen bajo proyectos comunes, donde la magnitud y complejidad de los mismos es creciente. Los requerimientos iniciales definen el alcance del proyecto y sufren cambios a lo largo de su ejecución, más aún cuando la naturaleza incierta y variable del entorno impactan en el plan original. Este tipo de organizaciones ha tomado consciencia de la necesidad de controlar los riesgos lo más tempranamente posible, ya que es clave para el éxito de las relaciones cliente-servidor. Así, la gestión de los riesgos y el manejo de los cambios en los requerimientos han cobrado importancia. Las propuestas tradicionales de (re)planificación de proyectos no capturan las relaciones complejas entre riesgos, requerimientos y el plan del proyecto. En este trabajo, se presenta un modelo integrado para (re)planificación de proyectos que incluye la gestión de cambios en los requerimientos así como de los riesgos asociados a cada proyecto. A modo de ejemplificar su aplicación, se ha desarrollado un caso de estudio en el contexto de la industria farmacéutica, ya que la misma responde a las características de las organizaciones fractales basadas en proyectos, donde el proyecto se vuelve la base sobre la cual este tipo de industria se sustenta y los riesgos tienen un tratamiento especial debido a la naturaleza de la industria.