Aplicaciones de las nuevas técnica de secuenciación masiva (NGS: Next generation Sequencing) al estudio de los síndromes linfoproliferativos

IRMA SLAVUTSKY

Resistencia

Congreso; CUBRA XV - Congreso Nacional Bioquímico 2019; 2019

Asociación Bioquímica Argentina

Las neoplasias del sistema linfoide constituyen un grupo heterogéneo de patologías con un amplio espectro de variación desde el punto de vista clínico, morfológico, inmunofenotípico, citogenético y molecular. Las mismas se encuentran asociadas a rearreglos en genes implicados en diferentes caminos de señalización así como a cambios epigenéticos que determinan patrones de metilación aberrante y alteración en la expresión génica, contribuyendo al proceso de transformación neoplásica. Datos de la literatura muestran un incremento de su incidencia a nivel mundial, encontrándose entre las más frecuentes causas de muerte. Un aspecto característico de estas entidades es la diferencia en la evolución clínica de los pacientes, observándose casos que presentan una larga sobrevida mientras que otros mueren rápidamente debido a progresión de la enfermedad. Si bien los sistemas de estadificación actuales proveen información valiosa respecto al pronóstico, no existen aún marcadores biológicos capaces de predecir con certeza esta evolución heterogénea en estadios iniciales de la enfermedad. En este contexto, los estudios genéticos resultan fundamentales para profundizar el conocimiento de los mecanismos moleculares involucrados en la patogénesis de las neoplasias linfoides, siendo primordiales al momento del diagnóstico y/o de la recaída de la enfermedad así como de suma utilidad para la toma de decisiones terapéuticas. Uno de los desafíos actuales es la identificación de nuevos marcadores moleculares involucrados en el proceso de iniciación, progresión y respuesta al tratamiento. La introducción de las nuevas técnicas de secuenciación masiva (NGS) ha revolucionado el conocimiento de las bases genéticas de estas patologías, permitiendo el estudio de miles de billones de secuencias en forma simultánea y con muy alta sensibilidad. Entre las aplicaciones de NGS se incluyen: análisis del genoma, exoma, genes target, transcriptoma, paneles de genes, que implican diferentes estrategias que recaen en la combinación de la preparación del templado a estudiar, la secuenciación, alineamiento y ensamblado de los fragmentos genómicos. La alta sensibilidad de estas técnicas ha hecho factible el hallazgo de nuevos cambios genómicos con implicancias a nivel pronóstico y terapéutico, la detección de mutaciones asociadas a resistencia al tratamiento, que pueden ser detectadas tempranamente, cuando el clon patológico emergente aún se encuentra en muy bajo porcentaje, y permitido la expansión de opciones terapéuticas que han mejorado la sobrevida de los pacientes. También resulta posible definir la presencia de más de una mutación, y si estas son producto de evolución clonal (mutaciones compuestas) o si pertenecen a clones diferentes (mutaciones policlonales). Asimismo, hacen factible la identificación de variantes genéticas para realizar estudios farmacogenómicos que permiten predecir la respuesta a fármacos. Sin duda, resultan relevantes en el área de Onco-Hematología, aportando información para una mejor caracterización biológica de estas patologías, pudiendo ser fuente, en un futuro, de nuevos blancos terapéuticos.