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Se estima que más de un tercio de la población mundial se ha infectado por el VHB y de estos el 5% son portadores crónicos, además el 80% de los hepatocarcinomas tienen como agente causal el VHB, constituyendo la segunda causa de cáncer mundial. El VHB codifica una proteína multifuncional llamada X. En el núcleo, X altera la expresión de genes que regulan el ciclo celular y estimula la trascripción viral e interacciona con proteínas implicadas en la reparación del daño al ADN como DDB1, DDB2 y UVDDB. En el citoplasma, X estimula vías de transducción de señales, alterando la adhesión, proliferación y muerte celular por apoptosis [1]. También influye en los niveles de calcio citosólico por un mecanismo aún desconocido. Sin embargo la estructura de la proteína X así como las bases moleculares de estas interacciones aún no han sido dilucidadas. Análisis comparativos de la secuencia genómica de X de diferentes especies de hepadnavirus revelan áreas altamente conservadas. Por otro lado, análisis espectroscópicos de la proteína X mutada, sugieren que la proteína no contiene ningún motivo estructural significativo ni homología de secuencia con otros factores activadores de la trascripción. Algunos autores especulan que se trata de una proteína intrínsecamente desestructurada que puede plegarse por unión a las moléculas target [2]. Esta flexibilidad conformacional podría explicar parcialmente su complejidad funcional, es decir su capacidad para afectar una amplia variedad de vías de señalización e interactuar con reguladores transcripcionales. Un primer análisis llevó a descartar el modelado por homología ya que no se ha encontrado similitudes estructurales con ninguna proteína de estructura conocida ni por análisis de secuencia ni por técnicas de reconocimiento de plegamiento. Lo antes mencionado lleva al acercamiento estructural de la proteína X por técnicas de modelado de novo o ab initio [3, 4]. Contar con un modelo tridimensional de X permitiría avanzar con análisis de interacción proteína-proteína, esclarecer la relación entre estructura y función y su relación filogenética y evolutiva ya que no posee ningún homólogo de estructura conocida