IQUIFIB 02644
INSTITUTO DE QUIMICA Y FISICOQUIMICA BIOLOGICAS "PROF. ALEJANDRO C. PALADINI"
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Modelado mixto de novo y homología- de la proteína X del Virus de la Hepatitis B
Autor/es:
ELIN TEPPA; JOSE MARIA DELFINO; JAVIER SANTOS; CRISTINA MARINO BUSLJE
Lugar:
Universidad Nacional de Quilmes
Reunión:
Workshop; Biología Computacional de Proteínas; 2009
Institución organizadora:
Universidad Nacional de Quilmes
Resumen:
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El virus de la hepatitis B (VHB) es un virus hepatotrópico que puede causar una amplia gama de manifestaciones clínicas que van desde la hepatitis aguda a hepatitis crónica y carcinoma hepatocelular. La Hepatitis B crónica es una de las diez principales causas de muerte en el mundo con más de 350 millones de personas infectadas1. Además, es la segunda causa de cáncer siendo responsable de hasta el 80% de los casos de cáncer de hígado2.
Se sabe que la pX está involucrada en la hepatocarcinogénesis, aunque se desconocen aún los mecanismos moleculares involucrados.
El objetivo del presente trabajo es elaborar un modelo teórico de la estructura tridimensional de la proteína X del VHB.
Mediante análisis de secuencia y técnicas de reconocimiento de plegado no se han encontrado similitudes estructurales con ninguna proteína de estructura conocida, descartando en un primer momento el modelado por homología.
De los métodos disponibles para realizar un modelo de novo, se seleccionó el método Rosetta de novo con restricciones utilizando el paquete de programas integrado Rosetta. Debido a que el modelo generado sólo se aproxima a cumplir las restricciones impuestas, el modelo fue mejorado por técnicas de dinámica molecular. Finalmente como la región comprendida entre las posiciones 12-56 del modelo sugieren la presencia de una lámina β, esta región fue modelada por homología con el programa Modeller. Si bien no contamos con suficientes pruebas que nos permitan afirmar la semejanza del modelo con la estructura nativa, es un primer acercamiento a la estructura tridimensional de la proteína.
