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C. brachyurus es un carnívoro neotropical categorizado "En Peligro" para Argentina, donde se encuentra el límite austral de su distribución. Según algunos autores se produjo una reducción de su área de distribución que puede deberse a presiones antrópicas y cambios en las precipitaciones y temperaturas en los últimos 200 años. Este trabajo tiene por objetivo obtener datos sobre la diversidad genética de esta especie y conocer si existe estructuración poblacional dentro de su área de distribución en Argentina. Analizamos 510 pb de la Región Control del ADN mitocondrial. En 34 muestras estudiadas se encontraron 12 haplotipos, un elevado valor de diversidad génica (0.8311) y haplotipos compartidos entre Santa Fe, Corrientes y Chaco aunque la población Correntina fue significativamente diferente a las otras dos. Los resultados de AMOVA arrojaron mayor variación dentro de los grupos (78.02%) que entre ellos (5.77%) (grupos: Córdoba, Chaco y Santa Fe vs Corrientes). El valor de Fst (0.21976 p= 0.01564) fue significativo. Los test de neutralidad de Tajima y Fu & Li, la distribución de diferencias de a pares y la distribución de los haplotipos en las redes obtenidas por Network y TCS, evidencian expansión demográfica. En los análisis filogenéticos (MP, ML, ME, Bayes) las topologías obtenidas fueron similares y no se encontraron unidades evolutivas correlacionadas con la localización geográfica de las poblaciones muestreadas. Santa Fe y Chaco presentan haplotipos únicos pero comparten la mayoría de ellos. No existen evidencias de estructuración poblacional a nivel del ADN mitocondrial entre las localidades. Es importante sumar muestras de Corrientes al estudio para hacer un análisis exhaustivo incluyendo genes nucleares para esclarecer las diferencias de la población Correntina con el resto de las localidades y así sugerir medidas de manejo y conservación. A tal fin, los resultados serán cotejados con datos de marcadores nucleares de 10 loci de microsatélites.