Diferenciación cinética en modelos de señalización celular: utilizando información codificada en los en etapas transitorias de las respuestas

ALEJANDRA C VENTURA

Buenos Aires

Exposición; Seminarios Instituto del Cálculo; 2023

Instituto del Cálculo, FCEyN, UBA

La cooperatividad negativa es un fenómeno en el que la unión de un primer ligando o molécula disminuye la tasa de unión posterior. Esta definición no es exclusiva de la unión ligando-receptor, se mantiene siempre que dos o más moléculas se someten a dos reacciones de asociación-disociación sucesivas. La cooperatividad negativa vuelve la curva de respuesta más gradual y no puede ser distinguida de dos reacciones independientes y diferentes utilizando mediciones de equilibrio (indistinguibilidad en equilibrio). La necesidad de datos cinéticos en este problema ya fue reportada. En este trabajo, estudiamos la respuesta de unión en función de la cantidad de ligando, a diferentes tiempos, desde tiempos muy tempranos desde que se agrega el ligando y hasta que se alcanza el equilibrio. Sobre estas curvas medidas a diferentes tiempos, calculamos el rango dinámico: el cambio requerido en el nivel de ligando para provocar un cambio del 10 al 90% en la respuesta, encontrando que evoluciona en el tiempo de manera diferente y controlado por diferentes parámetros en las dos situaciones que conducen a indistinguibilidad en el equilibrio.