Doctor en Bioquímica
Bioquímica

PROFESIONAL ASISTENTE

Tareas generales dentro de la UE: Se pretende continuar con las tareas de renovación, mantenimiento, control y registro del cepario del laboratorio. Realizar la reparación, mantenimiento y calibración del equipamiento de la UE que surjan. Se prevé continuar con la puesta a punto de técnicas y nuevas metodologías de trabajo que se requieran en el marco de los diferentes proyectos de investigación. Actividades específicas en el área de Biología Molecular: Se propone actualizar el stock de reactivos e insumos plásticos del sector de Biología Molecular. Se prevé optimizar la configuración y uso del software del equipo QuantGene 9600, y realizar una búsqueda bibliográfica respecto de genes de referencia que podrían utilizarse en el género Rhodococcus para el desarrollo de PCR en Tiempo Real. El objetivo es adecuar una metodología de trabajo que pueda ser utilizada en las diferentes líneas de investigación en las que se trabaja sobre la expresión relativa de genes pertenecientes a este género bacteriano. Actividades vinculadas al PUE N° 033: Considerando la capacidad fisiológica de la cepa V. indigofera EB para producir un compuesto con propiedades anticongelantes y un polímero extracelular con potencial de aplicación para reducir el impacto de las bajas temperaturas en plantas de la región patagónica, en el período 2022 se propuso llevar a cabo un estudio sobre la interacción planta-bacteria bajo condiciones controladas, el cual será realizado durante el período siguiente. Para ello se inocularán hojas de la planta en estudio con la cepa de interés y, con el extracto crudo del polímero extracelular. Luego se realizará la medición de temperatura de nucleación del hielo y de congelamiento extracelular en las hojas inoculadas y en hojas control. Este estudio permitirá definir si alguno de estos compuestos bacterianos posee actividad crioprotectora para las plantas. Por otra parte, una de las actividades más recientes que se están desarrollando en el laboratorio se enfoca en la supervivencia de aislados bacterianos a bajas temperaturas (-20 y -80°C). La criopreservación tiene como objetivo el mantenimiento de la funcionalidad y viabilidad celular a bajas temperaturas a lo largo del tiempo. Se colaborará en esta tarea evaluando la capacidad crioconservativa de sobrenadantes bacterianos sobre bacterias con diferente afiliación taxonómica luego de mantenerlas durante 30 días a las temperaturas previamente mencionadas. Luego de ese tiempo, a través del recuento de unidades formadoras de colonias (UFC), se analizará la supervivencia de cada uno de los aislados bacterianos. En el marco del PUE N° 033 y de otros proyectos de investigación en curso como el PICT 2020 denominado: "Adaptaciones metabólicas en bacterias oleaginosas del género Rhodococcus en respuesta a variaciones en la disponibilidad de nitrógeno", se propone continuar con la caracterización fisiológica y molecular de cepas modelo y recombinantes del género Rhodococcus en lo que respecta a su capacidad metabólica para la producción de lípidos y otros compuestos de interés biotecnológico. En este sentido, se prevé analizar la expresión relativa de genes implicados en la cadena respiratoria de la cepa R. jostii RHA1 en condiciones de déficit y exceso de nitrógeno. Para ello se realizará la búsqueda de los genes y/o clusters génicos vinculados a la misma, análisis de estos genes en las bases de datos ómicas disponibles y posterior selección para el análisis mediante PCR en tiempo real. Este análisis permitirá además adquirir adiestramiento en las metodologías de extracción de ARN, purificación, conversión a cDNA y en la utilización del equipo Quantgene 9600. Conjuntamente se propone indagar en la utilización de nuevos genes blancos que podrían ser incorporados en Rhodococcus para optimizar los rendimientos de biomasa y/o producción de aceites en estas bacterias. Se pretende analizar como potencial candidato el gen Vhb de Vitreoscilla sp, ya que ha cobrado interés debido a que su expresión en condiciones de baja tensión de oxígeno permite una mayor producción de ciertos metabolitos y/o rendimientos de biomasa. Es por ello que se considerará a este gen para llevar a cabo la sobreexpresión en cepas modelo del género y evaluar su impacto en la productividad de lípidos y en la cantidad de biomasa generada. Convenios de trabajo entre la UE y DIRANSA SRL: Con el objetivo de profundizar el conocimiento acerca de la potencial capacidad de producción de acrilamida por bacterias del género Rhodococcus, se continuarán indagando nuevas especies de la colección de cepas de la UE en cuanto a la presencia o ausencia de genes nitrilo hidratasas en los genomas disponibles en bases de datos, estas cepas se enviarán posteriormente a la empresa donde se llevará a cabo luego la caracterización fisiológica. Capacitaciones: Se considera acceder a cursos que me permitan adquirir nuevos conocimientos y capacidades en el área de Biología Molecular y/o bioinformática.

SCHOLZ, FABIAN GUSTAVO / INV PRINCIPAL

[INBIOP] INSTITUTO DE BIOCIENCIAS DE LA PATAGONIA -
[CCT CENPAT] CENTRO CIENTIFICO TECNOLOGICO CONICET - CENTRO NACIONAL PATAGONICO -
[CONICET] CONSEJO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS Y TECNICAS -