Dos metodologías analíticas para determinar RNA del SARS-CoV-2 en aguas residuales por RT-qPCR. Aplicación para estudiar la dinámica de circulación comunitaria durante la primera ola epidémica en Mendoza, Argentina

MAXIMILIANO GIRAUD-BILLOUD; PAULA CUERVO; JORGELINA ALTAMIRANO; MARCELA PIZARRO; JULIETA N. ARANIBAR; ISRAEL A. VEGA

Congreso; XI Congreso Argentino de Química Analítica; 2021

La epidemiología basada en aguas residuales (WBE) es una herramienta emergente la cual permite obtener información temporal y espacial sobre el estado puntual de salud pública de la población. Su uso podría utilizarse para la detección de ARN del SARS-CoV-2 y así, aplicar para seguir el estado epidemiológico y detectar brotes virales tempranamente, lo que podría anticipar un aumento de casos clínicos a nivel poblacional. Además, WBE podría utilizarse para superar la dificultad de detectar casos asintomáticos que representan un reservorio natural de SARS-CoV-2 y complementar las pruebas clínicas de diagnóstico. Para tal fin, se implementaron dos métodos de preparación de muestras para determinación cuali- y cuantitativa del ARN basada en dos marcadores de nucleocápside (N1 y N2) del SARS-CoV-2 mediante RT-qPCR. Las metodologías analíticas incluían metodologías diferentes de pre-concentración y aislamiento del ARN. Una de las metodologías de preconcentración se basó en la precipitación del ARN con polietilenglicol y la otra, en la co-precipitación del ARN con flóculos de aluminio. Para la etapa de aislamiento del ARN, posterior a la pre-concentración y previo a la determinación, se aplicaron técnicas de extracción en fase sólida utilizando sorbentes comerciales diferentes para cada metodología de pre-concentración mencionada. Las metodologías analíticas fueron aplicadas en forma conjunta para estudiar la dinámica epidemiológica de una población de aproximadamente 1.000.000 de habitantes de la provincia de Mendoza, Argentina, en el período julio 2020 y enero 2021. Para ello se combinó el uso de Epidemiología Basada en Aguas Residuales (WBE) de dos plantas de tratamiento de aguas residuales (Campo Espejo y El Paramillo) y se contrastó con datos oficiales de vigilancia epidemiológica de la población en estudio.Nuestros resultados nos permiten rastrear el aumento, el crecimiento exponencial, la meseta y la caída de las infecciones por SARS-CoV-2 durante 24 semanas. Un análisis individual de cada planta de tratamiento mostró una correlación positiva entre la positividad de la muestra de aguas residuales (%) o el número de copias genómicas de SARS-CoV-2 contra casos de COVID-19 diagnosticados por semana. Nuestros hallazgos indican que WBE es un indicador epidemiológico eficiente y útil para anticipar el aumento de casos de COVID-19 y monitorear el avance de la pandemia y las diferentes olas de infecciones.