Expresión de la familia TcTASV de T.cruzi: minería de datos de expresión y correlación con datos experimentales.

RIZZI, M; RODRIGUEZ, ME; CAEIRO, L; SANCHEZ, DO; TEKIEL, V

Santa Fe

Congreso; XXVIII Reunión Anual del la Sociedad Argentina de Protozoología y Enfermedades Parasitarias, Santa Fe, 26-28 de Nov de 2016; 2016

Sociedad Argentina de Protozoología y Enfermedades Parasitarias

La familia de proteínas de superficie TcTASV de T. cruzi, está compuesta por aproximadamente 40 miembros. No posee ortólogos en otros organismos y está conservada en diferentes linajes de T. cruzi. De acuerdo a la longitud, secuencia y motivos de la región central de las proteínas se definen 4 subfamilias: TcTASV-A, B, C y W. Realizando minería de datos de expresión (RNAseq y proteómica) y secuencias disponibles en bases de datos, intentamos identificar secuencias ó motivos que podrían estar determinando las diferencias en el patrón de expresión entre estadios de T. cruzi. Analizando los datos de RNAseq de la cepa Y (TcII) (Li et al, 2016) observamos que en este linaje los mRNAs de TcTASVs de todas las subfamilias también están sobrerrepresentados en el estadio tripomastigote (T) respecto del amastigote (A). Los transcriptos pueden ser agrupados de acuerdo a su nivel de sobre-expresión: HiHi sobre-expresados más de 20 veces (genes TcTASV-A, B y C), y HiLow sobre-expresados hasta 4 veces (en éste grupo sólo encontramos 2 genes TcTASV-A). En relación con datos de proteómica, se identificaron por primera vez péptidos de genes TcTASVs sobre-expresados en tripomastigotes sanguíneos, que no habían sido identificados en tripomastigotes de cultivo ni otros estadios (Brunoro et al, 2014). Los patrones y niveles de expresión pueden estar determinados al menos en parte por las secuencias de los 3?UTRs. El análisis de estas regiones mostró dos grupos principales: uno (G1) dentro del cual segregaron los genes HiHi y otro (G2) en el cual segregaron los genes HiLow y un gen identificado por proteómica. Cada grupo presentó alta identidad de secuencias en los 3?UTR (90%) pero entre grupos (G1 vs G2) la similitud fue de ~20%. Llamativamente todos los genes del G2 pertenecen a la subfamilia TcTASV-A. Esto sugiere fuertemente que las diferencias en el 3`UTR podrían explicar el patrón de expresión diferencial de TcTASV. Previamente, demostramos que en la cepa CL Brener la subfamilia TcTASV-C se expresa en tripomastigotes y TcTASV-B lo hace tanto en tripomastigotes como en amastigotes. Observamos que ambas subfamilias tienen localización preferencial en superficie, aunque sólo TcTASV-C es secretada en forma soluble y en vesículas extracelulares. Por otro lado, la subfamilia TcTASV-A se expresa en T y A intracelulares. Actualmente estamos analizando las regiones amino y carboxi terminales para identificar motivos proteicos que pudieran modular la localización de las TcTASVs.