Análisis de la diversidad genética de Jarava neaei (Poaceae, Pooideae, Stipeae)

SCLOVICH, SERGIO E.; SILVANA M. SEDE; SANTIAGO MORELLO; LILIANA M. GIUSSANI

Valle Hermoso, Córdoba

Jornada; 1ra Reunión Argentina de Biología Evolutiva (RABE); 2015

Varias

arava neaei es una gramínea endémica de América del Sur que se distribuye ampliamente en la región Patagónica y parte de la región de Cuyo, en Argentina, en estepas subarbustivo-graminosas abiertas y en el monte. Los estudios filogenéticos de nuestro grupo deinvestigación son los primeros en elucidar las relaciones de parentesco entre esta especie y géneros de la tribu Stipeae. Nuestro siguiente objetivo es elucidar la historia evolutiva de J. neaei y como punto de partida para estudios filogeográficos se propone como objetivos:Conocer la variabilidad genética intra e interpoblacional de Jarava neaei.Conocer los patrones de estructura genética en su rango de distribución.Se realizó la extracción de ADN total mediante un protocolo estándar con CTAB3 de 152 individuos pertenecientes a 22 localidades de todo el rango de distribución de Jarava neaei.Para el estudio de la variabilidad genética se implementó la técnica de AFLP. Se utilizaron dos combinaciones de cebadores: E35 (ECO-ACA)-M36 (MseI-ACC) y E37 (ECO ACG)-M37 (MseI-ACG). La matriz de presencia/ausencia de fragmentos se obtuvo con el programa RawGeno y sobre esta se calculó: el número de fragmentos totales y el número de fragmentos exclusivos por localidad. Se calculó la proporción de loci polimórficos y el índice de diversidad de Nei por sitio con AFLPdat implementado en el entorno R. Para el estudio de la estructura genética se realizó un análisis de coordenadas principales(PCOA) con el paquete APE a partir de la matriz de distancias de Jaccard calculada con el paquete VEGAN, ambos implementados en R y se analizó la estructura genética de las poblaciones mediante asignación Bayesiana (AB)con el programa Structure, que asigna las mismas a diferentes grupos genéticos (K).Se obtuvo una matriz de 152individuos y 326 fragmentos. Se observaron 11 sitios con 19 fragmentos exclusivos. La proporción de fragmentos polimórficos por sitio varió entre0,13 (sitio3) y 0,39 (sitio 22).El índice de diversidad de Nei varió entre 0,05 (sitio3) y 0,18 (sitio5).Se registraron valores altos de diversidad por sitio (>0,13) en el centronortede la provincia de Santa Cruz (sitios 21 y 22),el sitio 1 en el centro dela provincia de Neuquén y el sitio5 al sur de la provincia de San Juan. El PCoA mostró tres agrupamientos de los individuos que se corresponden con los grupos (K = 3) obtenidos por AB(Fig. 1B, C). Estos grupos muestran una coherencia geográfica (Fig. 1A): uno se corresponde con el rango de distribución geográfica de la especie, otro se ubica al oeste entre Mendoza y Chubut y el último se ubica en el norte de la provincia de Santa Cruz. Cabe destacar que laspoblaciones 21 y 22 asignadas a este último grupo (rojo) tienen además una alta proporción de loci polimórficos, altos valores de diversidad de Nei y loci exclusivos (2 y 3  respectivamente).