Rodopsinas de altura: de Baltoro a la Puna

ELIAS, D; KURTH, D; FARIAS, ME

Encarnación

Jornada; Jornadas de Jóvenes Investigadores Asociación Universidades Grupo Montevideo 2017; 2017

Asociación Universidades Grupo Montevideo

<!--br{mso-data-placement:same-cell;}table{mso-displayed-decimal-separator:"\.";mso-displayed-thousand-separator:"\, ";}tr{mso-height-source:auto;mso-ruby-visibility:none;}td{border:.5pt solid windowtext;}.NormalTable{cellspacing:0;cellpadding:10;border-collapse:collapse;mso-table-layout-alt:fixed;border:none; mso-border-alt:solid windowtext .75pt;mso-padding-alt:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt; mso-border-insideh:.75pt solid windowtext;mso-border-insidev:.75pt solid windowtext}.fontstyle0{font-family:Caladea-Regular;font-size:11pt;font-style:normal;font-weight:normal;color:rgb(0,0,0);}.fontstyle1{font-size:12pt;font-style:normal;font-weight:normal;color:rgb(0,0,0);}-->La Puna es un altiplano que se encuentra en el área central de la cordillera de los Andes y se caracteriza por ser un ambiente extremo. En esta clase de ambientes es probable encontrar comunidades microbianas cuyo metabolismo depende principalmente de recursos no orgánicos, como la luz solar.Las rodopsinas son proteínas transmembrana que al interactuar con el retinol pueden captar la luz y realizar distintas funciones.El objetivo de este estudio fue determinar si la abundancia y tipo de rodopsinas microbianas de lagunas de la Puna difieren a las de otros ambientes. Para ello, se procesaron 5 metagenomas de lagunas de la Puna, junto con 883 metagenomas de otros ambientes disponibles en EBI Metagenomics. El procesamiento comenzó por la detección de lecturas vinculadas a rodopsinas, usando el programa HMMER con el perfil de Micrhode. Y continuó con su ensamblado utilizando el programa MEGAHIT. Luego se detectaron los fragmentos de rodopsinas con FragGeneScan y HMMER, evaluando la longitud, score, cobertura y región donde se alineaban. Posteriormente se ubicaron los fragmentos en el árbol filogenético de Micrhode con PPLACER. Y por último, se agruparon los metagenomas en función de la proporción de lecturas asociadas a los clados del árbol.El principal resultado fue que la mayor proporción de lecturas vinculadas a rodopsinas de la Puna se ubicó en un único clado, junto a los de crioconitas de los glaciares alpinos Forni (Italia) y Baltoro (Pakistán), que se encuentran a más de 2600 metros de altura. Dicho clado estaría relacionado a las xantorodopsinas, las cuales son rodopsinas bacterianas que funcionan como bombas de protones asociadas a pigmentos antena. Este hallazgo indicaría que la luz solar es de vital importancia para estas comunidades.