Secuenciación del genoma de una cepa patagónica de Aureobasidium pullulans con potencial biotecnológico y un reloj circadiano funcional

MICAELA PARRA; DIEGO LIBKIND; NICOLAS BELLORA

Mendoza

Congreso; Congreso internacional, Reunión ALAG 2019; 2019

Sociedad Argentina de Genética

Existe un creciente interés en el estudio de Aureobasidium pullulans, un hongo adaptado a un amplio rango de condiciones ecológicas con gran potencial biotecnológico. A partir del descubrimiento de un reloj molecular en la cepa patagónica CRUB 1823, esta especie se propone como modelo para el estudio de ritmos circadianos en relación a la producción de metabolitos secundarios. En este trabajo se presenta el ensamblado y análisis del genoma de la cepa CRUB 1823. Se construyeron librerías paired-end y la secuenciación se realizó con Illumina Genome Analyzer II. Los reads resultantes de 251 pb se procesaron por calidad usando BBDuk. Se realizó un ensamblado de novo utilizando SPAdes. Para la predicción y anotación génica se utilizó el pipeline incorporado en Funannotate. El ensamblado resultó en un genoma de 27,83 Mpb con una cobertura de 20X, un N50=564 kbp y un contenido de GC de 50,32%. Se predijeron 10030 genes y se anotaron 9636 proteínas y 261 ARNt. Se identificaron genes con el potencial codificante de proteínas del reloj molecular y de enzimas implicadas en la síntesis de pululano y moléculas fotoprotectoras. El análisis de distancias genómicas (Kr) reveló que la CRUB 1823 se diferencia del grupo de cepas de la misma especie, que incluye tanto aislamientos europeos como otros de origen patagónico, indicando que podría tratarse de una nueva especie. La caracterización de los componentes del reloj molecular será potencialmente útil para su aplicación en mejoramiento biotecnológico y proveerá información sobre la evolución de mecanismos circadianos en hongos.