CIFASIS 20631
CENTRO INTERNACIONAL FRANCO ARGENTINO DE CIENCIAS DE LA INFORMACION Y DE SISTEMAS
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Uso y perspectivas en la SfGD: acceso eficiente e integridad de la información.
Autor/es:
L. ANGELONE, P. FERNÁNDEZ, A. PONS, B. CLAVIJO, C. REYNARES, P. BULACIO, N. PANIEGO, E. TAPIA
Lugar:
Rosario
Reunión:
Jornada; V Jornadas de Ciencia y Tecnología Organizada por la Secretaría de Ciencia y Tecnología de la UNR; 2011
Institución organizadora:
UNR
Resumen:
La base de datos SfGD (Sunflower Genomic Database) fue diseñada para alojar
datos e información derivada del procesamiento de secuencias ADNc de girasol
(Helianthus annuus L.), investigación desarrollada dentro del marco de un
proyecto de genómica funcional de girasol llevado a cabo en INTA Castelar. El
conjunto de datos incluye, secuencias de ESTs, unigenes derivados del
ensamblado de los mismos, su anotación funcional, catálogo de etiquetas de
reconocimiento inequívoco para cada unigen y datos de estudios de expresión
ante desafíos frente a estrés abiótico (frío y salinidad). Actualmente la base
de datos se encuentra alojada en el servidor del INTA, bajo el dominio http://bioinformatica.inta.gov.ar/sunflower/,
con acceso restringido de usuario y contraseña. La información biológica fue
curada y cargada completamente, y está siendo usada por los investigadores del
Instituto de Biotecnología de INTA y miembros del PAE37100 en la extracción de
información útil para el proyecto genómico.
En este trabajo presentamos las mejoras que
se han realizado a partir de la versión 2010 referidas a su interfaz web y a la
administración de los datos, con el propósito final de la puesta en público. En
el aspecto de la interfaz, se agregaron funciones que permiten construir y
almacenar consultas en forma dinámica utilizando un lenguaje específico para usuarios
con formación biológica. Además, se incorporó filosofía AJAX para obtener una
recuperación de la información más eficiente y rápida. En lo referido a la
administración de los datos, con la firme convicción de preservar la integridad
de los mismos, se realizó un módulo independiente de ABM. Por lo cual, la base
de datos SfGD resultará más segura y los datos ómicos residentes en ella
serán fiables. Además, la base crecerá y se actualizará en función de las
nuevas investigaciones, independientemente de la web de usuario final. Con estas mejoras consideramos
que es inminente la implantación de la base de datos del girasol cultivado SfGD
como recurso de acceso público para la comunidad científico/académica
interesada en consultar información molecular asociada a esta especie de
interés agronómico.
