INVESTIGADORES
LOZADA mariana
congresos y reuniones científicas
Título:
DIVERSIDAD DE ENZIMAS EXTRACELULARES QUE DEPOLIMERIZAN ALGINATOS EN SEDIMENTOS DE BAHÍA USHUAIA
Autor/es:
CALDEROLI, PRISCILA A.; LOZADA, MARIANA; DIONISI, HEBE
Lugar:
Mar del Plata
Reunión:
Congreso; IV CAMAYA - I MicroGen; 2018
Institución organizadora:
Asociación Argentina de Microbiología
Resumen:
Los alginatos constituyen hasta un 40% del peso seco de las algas pardas, cuya biomasa dominalos ecosistemas costeros templados y fríos. En consecuencia, estos polisacáridos, polímeroslineales de los ácidos β-D-manurónico y α-L-gulurónico, representan una importante fuente decarbono y energía para los microorganismos heterotróficos que habitan estos ambientes. A pesarde constituir un paso relevante del ciclo del carbono de estos ambientes del cual participaría unaalta proporción de la comunidad microbiana, nuestro conocimiento sobre la estructura de losgremios alginolíticos y los mecanismos que utilizarían para asimilar a los alginatos es aún limitado.El objetivo de este trabajo fue estudiar la diversidad funcional de este gremio en sedimentosintermareales de Bahía Ushuaia, a partir del análisis de secuencias putativas de enzimas alginatoliasas (acción endolítica) y oligoalginato liasas (acción exolítica) identificadas en una bibliotecametagenómica secuenciada al azar. Utilizando Hidden Markov Models de las herramientas pfam ydbCAN, se identificaron 247 secuencias metagenómicas pertenecientes a 6 (PL5, PL6, PL7, PL14,PL15 y PL17) de las 7 familias de polisacárido liasas que incluyen estas enzimas a partir del set dedatos de 7 x 10 5 secuencias codificantes. Los scaffolds contenían entre 1 y 6 secuencias putativasde estas enzimas, y fueron asignados taxonómicamente a 10 diferentes phyla, siendoBacteroidetes, Proteobacteria y Planctomycetes los más abundantes. El 71% de las secuenciasidentificadas se encontraban completas, y más de la mitad de las mismas fueron altamentedivergentes de las secuencias depositadas en la base de datos CAZy, en su gran mayoríaprovenientes de cepas cultivadas y de las cuales menos del 4% han sido caracterizadasbioquímicamente. Las secuencias identificadas más novedosas provenían de scaffolds asignados alos phyla Planctomycetes y Actinobacteria. En particular, la familia PL5 presentó el más altoporcentaje de secuencias divergentes (94%), con 22% de ellas conteniendo módulos noidentificados previamente en esta familia de enzimas y 42% de las secuencias con residuos delsitio activo identificados como esenciales para la catálisis, no conservados. Estas secuenciasputativas de alginato liasas y oligoalginato liasas serán el punto de partida para estudiar la relaciónque existe entre las propiedades estructurales y catalíticas en estas familias de enzimas, y explorarsus posibles aplicaciones biotecnológicas.