Análisis in silico de genes de resistencia y virulencia en Inquilinus limosus.

PINO MARYLÚ; GUTKIND GABRIEL; DI CONZA JOSÉ

Ciudad Autonoma de Buenos Aires

Jornada; 157 Jornada Cientifica "Resistencia bacteriana y uso racional de los antibióticos"; 2013

Academia Nacional de Farmacia y Bioquímica

Desde que el género Inquilinus se caracterizó en 2002, se reportaron casos de infecciones/colonizaciones en pacientes con fibrosis quística (PFQ). Se caracteriza por presentar un perfil de multiresistencia a antimicrobianos y capacidad de persistir en el tracto respiratorio de estos pacientes. El aislamiento a partir de la muestra de esputo es dificultoso, aún cuando con anterioridad de que los cultivos resulten positivos pueda detectarse una respuesta serológica de tipo IgG específica frente a varios antígenos de Inquilinus. Aunque el nicho ecológico es desconocido, el análisis filogenético del género Inquilinus muestra su estrecha relación con Azospirillum, un microorganismo asociado a plantas. El ADNr 16S de I. limosus se recuperó de muestras ambientales, lo que sugiere un nicho ecológico ambiental. A fin de dilucidar su rol como patógeno emergente en humanos se procedió a secuenciar y analizar el genoma de la cepa I. limosus MP06, recuperado de un PFQ en Santa Fe, Argentina. La secuencia parcial del genoma se obtuvo mediante una estrategia whole genome sequencing mediante un pirosecuenciador GS 454 Titanium en INDEAR, Argentina, ensamblado con el software 454 Newbler, v.2.6, con cobertura mayor a 20X. Consistente a lo observado en microorganismos ambientales, el genoma presenta numerosos determinantes de resistencia a compuestos tóxicos. Se detectaron 99 genes posiblemente dedicados al metabolismo del azufre y dos operones de resistencia a arsénico dispersos en el genoma. También muchos determinantes de resistencia a cobre, cobalto, zinc y cadmio. Hasta el momento no se han detectado plásmidos. En el análisis realizado también se encontró un operón de virulencia que podría estar involucrado en la transcripción del ADN y la síntesis de proteínas ribosomales. Este operón, presenta una similitud del 40-50% con el descripto en Mycobacterium tuberculosis, el cuál le confiere la capacidad tanto para la invasión y la supervivencia intracelular en los macrófagos. También están presentes los genes que participan en el mecanismo reparador de ADN, altamente mutagénico, conocido como mecanismo de unión de extremos no homólogos (Non-homologous DNA End Joining), similar al que permite a las micobacterias evadir la defensa genotóxica del huésped. La descripción, comprensión y posterior evaluación de los genes o rutas implicadas en la virulencia y/o la defensa del microorganismo podrían explicar la capacidad de I. limosus para comportarse como patógeno oportunista emergente y persistir en las vías respiratorias de PFQ.