INVESTIGADORES
FERNANDEZ LARROSA Pablo Nicolas
congresos y reuniones científicas
Título:
EFECTO DE LA TEMPERATURA EN LA EXPOSICIÓN DE LA SECUENCIA BLANCO DEL MIR-29 EN EL mRNA DEL ONCOGEN RAC3.
Autor/es:
CEBALLOS C; R.D. RABINOVICH; P. N. FERNÁNDEZ LARROSA
Lugar:
Ciudad de Mar del Plata
Reunión:
Congreso; Reunión Anual Conjunta SAIC-SAFIS; 2015
Institución organizadora:
SAIC-SAFIS
Resumen:
Los miRNAs son RNAs regulatorios de pequeño tamaño, capaces de unirse al 3?UTR de los mRNAs interfiriendo con su traducción y regulando la expresión de los genes a nivel post-transcripcional. Previamente, hemos analizado in silico el rol de la temperatura en la modulación del plegado de los mRNAs virales (HIV-1), permitiendo la hibridización de miRNAs,los cuales actuarán promoviendo la degradación de dichos mRNA virales. Por otra parte, algunos miRNAs participan en la regulación del desarrollo tumoral. RAC3 es un oncogén cuya sobreexpresión en tumores juega un rol clave en el desarrollo tumoral, pero que además se encuentra regulado en diferentes etapas del mismo. El objetivo de este trabajo es el estudio in silico del efecto de la temperatura en el plegado del mRNA de RAC3 y la exposición a miRNAs codificados en el genoma humano. La secuencia del 3 ́UTR de RAC3 se obtuvo de GenBank y las secuencias de los miRNAs descriptos en miR-Base. Los software utilizados para dicho análisis fueron: RNAhybrid, mFOLD 2.3 y Ensemble calc en UNAFOLD. Se analizó in silico para la secuencia de RAC3 las regiones que se desapareaban con el aumento de la temperatura y si se exponía una secuencia blanco para algún miRNA descrito. Además, se calculó el DGo correspondiente al plegado en la zona de complementariedad para el par miRNA-gen. Se encontraron varias secuencias del mRNA de RAC3 que se exponían a 45°C (y que permanecían apareadas a 37°C), pero una de ellas (región 2314 a 2320) exponía una secuencia complementaria al miRNA-29, favoreciendo su hibridización. Estos resultados in silico sugieren un rol de la temperatura en la modulación del plegado del mRNA de RAC3 favoreciendo la exposición de secuencia blancos de miRNAs (como es el caso analizado del miR-29), que tienen un rol descrito en la regulación del desarrollo tumoral. Este fenómeno podría ser relevante en episodios de fiebre o pirogénesis local (producto a inflamación) y como aplicación terapéutica en el futuro.