Caracterización molecular de Strawberry polerovirus 1 en Argentina

LUCIANI C. E.; CELLI M G; PEROTTO M.C.; POZZI, E.A.; CONCI V. C

Congreso; 40º Congreso Argentino de Horticultura; 2018

H173. Sanidad y protección vegetalCaracterización molecular de Strawberry polerovirus 1 enArgentina Luciani1, C. E.; Celli1, M. G.; Perotto1, M. C.; Pozzi1, E. A. yConci1, V. C. 1. IPAVE-CIAP-INTA y CONICET. Correo: conci.vilma@inta.gob.arEl polerovirus recientemente detectado en plantas defrutilla en Canadá y Estados Unidos, Strawberry polerovirus 1 (SPV1), seencuentra ampliamente distribuido en las principales regiones productoras deArgentina. A través de la caracterización molecular es posible clasificarespecies virales, razas o variantes. El objetivo de este trabajo fue obtener lasecuencia de SPV1 de Argentina, y caracterizarlo molecularmente. Para ello, seextrajo el ARN de una planta de frutilla de Lules, Tucumán, infectada con SPV1y se secuenció con tecnología de secuenciación de alto rendimiento IlluminaHiSeq 1500 en INDEAR (Rosario, Argentina). Las lecturas obtenidas fueronensambladas de novo y se amplificaron por RT-PCR las porciones genómicas sinsecuenciar. Se obtuvo una secuencia de 5944 nt, la cual mostró una identidad de97% con las secuencias de SPV1 de Canadá (KM233705 y KM233706). La secuenciaargentina contuvo 6 marcos abiertos de lectura (ORF) típicos de lospolerovirus: ORF0, ORF1, ORF2, ORF3, ORF4 y ORF5. Cada ORF fue alineado con lassecuencias de SPV1 disponibles en el GenBank. Se calcularon los porcentajes deidentidad de nt y aa, los cuales variaron entre 96 y 100%. El ORF másconservado fue el ORF3 (100% para nt y aa), el cual codifica para la cápsideproteica del virus. El ORF más variable fue el ORF0 (96-97% para nt y 97% paraaa), que codifica para la proteína P0, la cual podría tener función deinhibición del silenciamiento viral. La construcción de un árbol filogenéticocon 99 secuencias de 30 polerovirus publicados en el GenBank, mostró ladiferenciación de dos grupos: I y II. SPV1 (grupo II) se diferenció de todoslos polerovirus analizados (grupo I) con bootstrap de 100%. SPV1 de Argentina,a su vez, se diferenció de las secuencias de SPV1 de Canadá, mostrandodiferencias significativas. Son necesarios mayores estudios acerca de cómoafectan las posibles variantes de SPV1 en el cultivo de frutilla.Financiación: INTA, CONICET.