INVESTIGADORES
PEROTTO Maria Cecilia
congresos y reuniones científicas
Título:
Evaluación De La Variabilidad Intraespecífica de la Cápside Proteica del Strawberry mild yellow edge virus
Autor/es:
TORRICO, A.K.; CAFRUNE, E. E.; PEROTTO M. C.,; CELLI M G; QUEVEDO, V.; CONCI V. C
Lugar:
Bogotá
Reunión:
Congreso; XXX Congreso Colombiano y XVI Latinoamericano de Fitopatología; 2011
Institución organizadora:
ALF
Resumen:
Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV) es uno de los virus de frutilla mas comunes y está mundialmente distribuido en las regiones productoras. El objetivo de este trabajo fue detectar la variabilidad intraespecífica del SMYEV presente en Argentina. Mediante DAS-ELISA con antisuero de BIOREBA (Latin América) se detectaron plantas de frutillas con síntomas de virus y plantas asintomáticas infectadas con SMYEV provenientes de diferentes regiones productoras de Argentina. Se amplificaron fragmentos genómicos de 861 pb que incluían el gen completo de la cápside proteica (CP) del virus, mediante RT-PCR con primers específicos. Se clonaron y secuenciaron dichos fragmentos. Las secuencias fueron analizadas usando software DNASTAR Lasergene 8 y se realizó un alineamiento múltiple de nucleótidos (nt) por el método de CLUSTAL W. Se identificaron 11 aislamientos argentinos diferentes mostrando un porcentaje de identidad de nt de la CP que varió entre el 81,3 y el 99,6% con otras 31 secuencias del SMYEV citadas en el GenBank provenientes de diferentes países. Mediante este análisis se confirmó la identidad de los aislamientos de acuerdos con los criterios de demarcación del ICTV (género Potexvirus, identidad menor a 72% de nt de la CP corresponde a diferentes especies). En el análisis filogenético se detectaron 4 grupos, o razas, del virus con valores de Bootstrap (n=1000), superiores a 72%. Los aislamientos argentinos estuvieron incluidos en todos los grupos. El Grupo I agrupó el mayor número de secuencias publicadas con un porcentaje de identidad de nt que varió entre 100 y 95,9%, el Grupo II entre 98,9 y 94,9%, el Grupo III entre 100 y 97,9%, y el Grupo IV entre 99,3 y 90,9%. Se continúa estudiando el resto del genoma viral para definir las variantes existentes.
