Análisis de la diversidad genética de Jarava neaei (Poaceae, Pooideae, Stipeae).

SCLOVICH, SERGIO E*,SEDE, SILVANA M, MORELLO, SANTIAGO, GIUSSANI, LILIANA M.

Cordoba

Jornada; I Reunión Argentina de Biología Evolutiva; 2015

RABE

Análisis de la diversidad genética de Jarava neaei (Poaceae, Pooideae, Stipeae) Sclovich, Sergio E*, Sede, Silvana M, Morello, Santiago, Giussani, Liliana M Instituto de Botánica Darwinion (CONICET-ANCEFyN) *ssclovich@darwin.edu.ar Palabras clave: AFLP, estructura genética, Jarava neaeiIntroducción Jarava neaei es una gramínea endémica de América del Sur que se distribuye ampliamente en la región Patagónica y parte de la región de Cuyo, en Argentina, en estepas subarbustivo-graminosas abiertas y en el monte [1]. Los estudios filogenéticos de nuestro grupo de investigación [2] son los primeros en elucidar las relaciones de parentesco entre esta especie y géneros de la tribu Stipeae. En un avance en el conocimiento de esta especie se propone como punto de partida para estudios filogeográficos: ?Conocer la variabilidad genética intra e interpoblacional de Jarava neaei. ?Conocer los patrones de estructura genética en su rango de distribución.Materiales y métodosSe realizó la extracción de ADN total mediante un protocolo estándar con CTAB [3] de 252 individuos pertenecientes a 36 localidades de todo el rango de distribución de Jarava neaei. Para el estudio de la variabilidad genética se implementó la técnica de AFLP [4]. Se utilizaron dos combinaciones de primers: E35 (ECO-ACA)-M36 (MseI-ACC) y E37 (ECO ACG)-M37 (MseI-ACG). La matriz de presencia/ausencia de fragmentos se obtuvo con el programa RawGeno [5] y sobre esta se calculó: el número de fragmentos totales y el número de fragmentos exclusivos por localidad. Se calculó la proporción de loci polimórficos, el índice de diversidad de Nei [6] y el indice de rareza [7] (DW, del inglés frequency-downweighted marker values) por sitio con AFLPdat [8] implementado en el entorno R [9]. Este último índice indica la proporción de un determinado fragmento en una localidad respecto de la muestra total. Para el estudio de la estructura genética se realizó un análisis de coordenadas principales [10] (PCOA) con el paquete APE [11] a partir de la matriz de distancias de Jaccard [12] calculada con el paquete VEGAN [13], ambos implementados en R y se analizó la estructura genética de las poblaciones mediante asignación Bayesiana (AB) con el programa Structure [14], que asigna las mismas a diferentes grupos genéticos (K).Resultados y discusiónSe obtuvo una matriz de 252 individuos y 590 fragmentos. Se observaron 11 sitios con 17 fragmentos exclusivos y un sitio con un fragmento exclusivo fijo (sitio 15). La proporción de fragmentos polimórficos por sitio varió entre 0,12 (sitio 26) y 0,623 (sitio 29). El índice de diversidad de Nei varió entre 0,05 (sitio 26) y 0,23 (sitio 29). El índice de rareza varió entre cero y 0.21 (sitio 29).La AB (Fig. 1B) mostró una coherencia geográfica para una asignación de tres grupos (K = 3), sin embargo se aprecian componentes genéticos compartidos entre poblaciones. El PCoA (Fig. 2) mostró tres agrupamientos principales de los individuos que coloreados según la AB refleja el patrón de agrupamiento asignado con componentes compartidos. Los grupos geográficos concordantes con el AB (Fig. 1) tienen distribuciones específicas: uno se corresponde con el rango de distribución geográfica de la especie (verde), otro se ubica al oeste entre Mendoza y Santa Cruz (azul) y el último se ubica en la provincia de Santa Cruz (rojo). Cabe destacar que en las provincias de Rio Negro, Chubut y Santa Cruz se registran la mayor cantidad de alelos privados y mayores valores de índice de rareza, mientras que la proporción de loci polimórficos mantiene valores intermedios en todos los sitios.El grupo genético tres (azul) tiene la mayor proporción de alelos privados y raros mientras que la proporción de de loci polimórficos y diversidades de Nei se mantiene en valores similares siendo levemente mayores en el grupo tres.