Caracterización de un transcriptoma de Inflorescencias de E. Curvula de plantas sometidas a sequía en relación con el modo reproductivo

CARBALLO JOSE; ZAPPACOSTA DIEGO; RODRIGO JUAN MANUEL; SELVA JUAN PABLO; GARBUS INGRID,; ECHENIQUE VIVIANA C

Rosario

Simposio; Simposio de Genómica Funcional de Plantas; 2017

El pasto llorón, Eragrostis curvula, es una gramínea perenne C4 originaria del surde África que se adapta a suelos arenosos y es tolerante a la sequía. Posee diferentesniveles de ploidía (2x hasta 8x, con x=10), siendo los diploides sexuales (2n=2x=20)mientras que los tetraploides son fundamentalmente apomícticos. En trabajosanteriores se comprobó que en situaciones de estrés se incrementa el número desacos embrionarios sexuales en individuos apomícticos facultativos. Con el fin dedeterminar cuáles son los genes responsables del cambio en el porcentaje de sacossexuales, se extrajo ARN de 3 panojas de plantas del cultivar apomíctico facultativoDon Walter INTA sometidas a sequía y de 3 cultivadas en condiciones óptimas de riego.Se realizó RNA-seq utilizando la tecnología Illumina Hi-seq. Como resultado de lasecuenciación se obtuvieron más de 312 millones de lecturas de muy buena calidadque fueron ensambladas mediante el software Trinity en 190.474 contigs. Utilizandoel criterio 5 TPM, se estableció que el trancriptoma del genotipo Don Walter consisteen ~30.000 transcriptos, entre los cuales se observaron algunas isoformas. Un análisisde expresión diferencial in silico, permitió identificar ~1.000 y ~3.000 transcriptossobrexpresados en la muestra sometida a estrés hídrico y la condición control,respectivamente. Este transcriptoma posibilitará identificar y validar entre estos genesdiferencialmente expresados a aquellos que están involucrados en los cambiosobservados en el incremento de sacos sexuales en E. curvula bajo condiciones dedéficit hídrico.