Avances en la secuenciacion del genoma de trigo y las posibilidades que brinda al mejoramiento asistido.

ECHENIQUE, V; HELGUERA M; TRANQUILI, G; PANIEGO N; CLAVIJO B; VANZETTI L; ROMERO J; GARBUS I; TABBITA F; BONAFEDE M; CATIVELLI M; RONCALLO P.; WRIGHT J; MARTIS M; CACCAMO M; VALARIK M; SIMKOVA H; DOLEZEL J ; MAYER K

Simposio; VIII Simposio Nacional de Biotecnologia . REDBIO; 2011

Fui invitada a dar esta presentación oral El trigo pan (Triticum aestivum L 2n= 6x=42; AABBDD) provee cerca del 55% de los carbohidratos consumidos por el hombre. Es una especie de genética compleja, su genoma es el de mayor tamaño entre los cereales, con más del 80% de secuencias repetitivas. Estas características han demorado su secuenciación, si bien se han generado numerosas herramientas genómicas (genotecas, mapas físicos, ESTs). En el año 2005 un grupo de productores, mejoradores y científicos crearon el Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma de Trigo (IWGSC) con el objetivo de obtener la secuencia completa de cada uno de los 21 cromosomas del cv. Chinese Spring. El IWGSC está actualmente integrado por 20 países a los cuales les ha sido asignado la construcción de mapas físicos y/o la obtención de secuencias de cada uno de estos cromosomas en forma individual. Argentina, a través del PAE37108, CONICET e INTA, participa con la secuenciación del cromosoma 4D. El ADN de cada brazo de este cromosoma se aisló por ?flow sorting? y se secuenció (secuenciador Roche 454 NGS, INDEAR) con una cobertura de 3.6x. Las secuencias han sido analizadas con diferentes algoritmos, estrategias y parámetros para su ensamblado. Con el mejor ensamblado obtenido se inició el desarrollo de marcadores cromosoma-específicos (SSR y ISBP), la caracterización de secuencias repetitivas y la anotación estructural y funcional de regiones codificantes y no codificantes. También se realizará un análisis comparativo con genomas de  especies relacionadas (genome zipper). Este aporte permite a Argentina acceder a la secuencia de los demás cromosomas. Además de conocer el genoma de esta especie se propone proveer a los mejoradores con herramientas y recursos para sus programas (marcadores, mapas, poblaciones, genes, etc.), acelerando el tiempo para la obtención de variedades portadoras de genes asociados a características de interés, como resistencia a condiciones ambientales extremas, calidad, resistencia durable a enfermedades, etc.