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La producción agrícola sustentable en la Puna cobra relevancia particular en este ambiente debido, fundamentalmente, a que sus suelos poseen bajo contenido de materia orgánica, son altamente susceptibles a la erosión y las condiciones ambientales son extremas a mas de 3500 m.s.n.m. Las comunidades microbianas edáficas involucradas en el ciclado de nutrientes y la promoción del crecimiento vegetal desempeñan un rol fundamental para contribuir a la fertilidad del suelo y al aprovechamiento de nutrientes por los cultivos. Teniendo en cuenta su importancia, los estudios sobre las funciones de estos microorganismos son aún insuficientes o nulos en los ecosistemas agrícolas de la Puna. Este trabajo tuvo como objetivo analizar la abundancia de genes microbianos involucrados en el ciclo del Nitrógeno y la formación de micorrizas por la colonización de raíces por hongos micorrícicos arbusculares en cultivos andinos bajo diferentes rotaciones instalados en un suelo de Abra Pampa, Jujuy. El estudio se realizó a campo, durante dos años, en un lote agrícola manejado con fertilización química acompañada de la incorporación de guano de llama compostado y riego por goteo. Los tratamientos analizados fueron: suelo A1-rotación papa 2020/quinoa 2021, suelo A2 -rotación quinoa 2020/triticale 2021, suelo GC -debajo del guano compostado sin mezclar y CT -prístino con vegetación nativa. Cada año se tomaron muestras raíces de las plantas y suelo asociado (0-20cm) y se determinó: 1) la abundancia relativa de los genes relacionados con la fijación biológica del N (nifH) y la desnitrificación (nirS y nosZ), mediante PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) y 2) el grado de colonización micorrícica y formación de arbúsculos a partir de raíces frescas. Los resultados mostraron diferencias significativas entre los tratamientos para ambas variables analizadas (p

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