Arquitectura de los integrones en el pangenoma de Shewanella.

MARÍA FLORENCIA RAPISARDI; SOFÍA MUCCI; GISELA PARMECIANO DI NOTO; CECILIA QUIROGA; DANIELA CENTRÓN

Congreso; XIII CONGRESO ARGENTINO DE MICROBIOLOGIA, II CONGRESO DE MICROBIOLOGIA AGRICOLA Y AMBIENTAL,; 2013

Las integrasas de integrón son proteínas de la familia de las tirosina recombinasas, que median la captación, expresión, y algunas veces la diseminación de los genes que se encuentran bajo forma de cassettes. En el género Vibrio se identificaron integrones ubicuos de especie que poseen más de 100 cassettes en su zona variable. Poco se sabe sobre la arquitectura de los integrones cromosómicos en otras especies bacterianas. Con el fin de realizar un análisis de abundancia, ubicuidad, localización y características genéticas dentro del género Shewanella, realizamos un estudio bioinformático con los genomas disponibles en la bases de datos públicas (GenBank). De un total de 24 genomas completos analizados, pertenecientes a 17 especies dentro del género Shewanella, pudimos identificar que el 43% posee al menos un gen de integrasa con una identidad que varía entre el 40% y el 70%. Además se pudo observar que los genomas S. baltica OS185 y S. putrefaciens 200 poseen dos genes que codifican para estas integrasas. La comparación de sus respectivas secuencias peptídicas mostraron que dichos genes corresponden a distintos alelos con 4 mutaciones cada uno. Estudios de filogenia demostraron que dentro del género de Shewanella las integrasas de integrón mostraron una elevada variabilidad entre sí, agrupándose en dos familias principales, IntI2 e IntI9. A diferencia de lo observado para los integrones cromosómicos de Vibrio spp., el análisis de 7 genomas completamente secuenciados de S. baltica indica que estos elementos genéticos no son ubicuos de especie. Asimismo, nuestros resultados sugieren que S. baltica posee el genoma más plástico entre todas las especies ya que se encontraron integrasas de ambas familias en un mismo aislamiento. Esto también se ve reflejado en la presencia de una integrasa de la familia de IntI9 localizada en un plásmido de S. baltica OS195. Por otro lado, el análisis de las regiones adyacentes de las integrasas mostró que éstas se asocian indistintamente a genes esenciales y otros elementos móviles. La gran variabilidad de integrasas de integrones identificados en este estudio, con diferentes localizaciones dentro de los genomas y con entornos diferentes dentro de una misma especie, muestran la gran adaptabilidad que presentan en este género y también que el rol de las integrasas de integrón difiere de una especie a otra.