CARACTERIZACIÓN PLASTÓMICA DE ESPECIES POLIPLOIDES DE PASPALUM (POACEAE) DEL GRUPO NOTATA S.S.

PERICHON M.C.; REUTEMANN A.VERENA; DAVIÑA JULIO R.; MARTINEZ E.J.; VALLS J.F.M.; RUA GABRIEL HUGO; CARABALLO ORTIZ MARCOS A.; ROMASCHENKO K.; PETERSON P. M.; HONFI ANA I.

CORRIENTES

Congreso; L CONGRESO ARGENTINO DE GENETICA; 2022

SOCIEDAD ARGENTINA DE GENETICA

El grupo Notata s.l., perteneciente al género Paspalum, reúne a especies gramíneas con potencial forrajero que son morfológicamente muy similares entre sí y presentan diferentes niveles de ploidía en base a x=10. Se estudiaron los genomas del cloroplasto (plastomas) de 5 especies del grupo a par-tir del ADN genómico total. Se prepararon bibliotecas genómicas y se secuenciaron utilizando tec-nología de secuenciación de alto rendimiento (genome skimming). Las secuencias limpias fueron ensambladas “de novo” usando el programa NOVOplasty (version 2.7.2) con dos tamaños de kmers (21 y 33 nucleótidos). Se logró ensamblar, circularizar y anotar 6 genomas de cloroplastos de las siguientes especies: P. barretoi diploide 2n=2x=20 (H3025), P. cerradoense 2n=2x=20 (RCO&CWFagg2787), P. cromyorhizon 2n=2x=20 (H1732), P. ellipticum octoploide 2n=8x=80 (ACM115), P. minus pentaploide 2n=5x=50 (V15484), P. notatum diploide 2n=2x=20 (H1961) y tetraploide 2n=4x=40 (H2690RB8). Los plastomas fueron anotados y visualizados utilizando los programas “GESeq”, “IRSCREEN” y “OGDRAW”. Las anotaciones incluyen genes, pseudogenes, y regiones invertidas, entre otras. Los análisis genómicos en progreso incluyen comparaciones estruc-turales entre genomas, identificación de regiones propensas a mutaciones, útiles para estudios pobla-cionales, y evaluación de tipos de selección en los genes.