Cinética de reconocimiento entre hebras de ADN inmovilizadas y secuencias parcialmente complementarias y secuencias parcialmente complementarias

BELEN PONCE; HELENA CERRETI; FERNANDO BATTAGLINI; RAMÍREZ, SILVANA A.; MONTSERRAT, JAVIER M.

Santa Rosa, La Pampa

Congreso; 10 Congreso Argentino de Química Analítica; 2019

Asociación Argentina de Químicos Analíticos

Los oligonucleótidos simple cadena son elementos de reconocimiento molecular apropiados para el diseño de sensores. La complementariedad entre hebras de ADN constituye la base para el desarrollo de una señal analítica. La formación de estructuras doble cadena es un proceso termodinámicamente favorable a temperatura ambiente (Kaf > 1.1015). Sin embargo, factores como la densidad superficial (hebras de ADN inmovilizadas/cm2)1, el número y la posición relativa de errores (mismatchs) en la hebra complementaria afectan la cinética del reconocimiento. Con el fin de explorar dichos factores, se diseñó una secuencia de ADN simple cadena de 27 nucleótidos con un grupo tiol para permitir el anclaje a una superficie de Au. A continuación se diseñaron secuencias complementarias con 0, 1, 3 y 5 errores de modo tal que las zonas no complementarias de la doble cadena resultante, estuvieran ubicadas próximas a la superficie de Au en un caso y alejadas de la misma en otro. Empleando microbalanza de cristal de cuarzo con disipación (QCM-D) se registraron, en tiempo real, las variaciones en la frecuencia y la energía disipada durante la hibridización. El cociente entre los moles de hebra complementaria reconociday el tiempo (Δn/Δt) evidenció cambios en la cinética de reconocimiento.