Análisis filogenético de seis cepas de Ganoderma applanatum basado en marcadores moleculares ITS

TEJERINA MARCOS RAUL; FONSECA MARIA ISABEL; RAMOS ANA BELEN; VILLALBA LAURA

Congreso; XIV CONGRESO LATINOAMERICANO DE GENÉTICA; 2010

Los espaciadores transcriptos internos o ITS son regiones en el ADN que están inmersos entre las regiones conservadas 18S y 26S que codifican para ARNr. Los ITS son útiles en estudios filogenéticos a nivel intra e interespecífico debido al polimorfismo que presentan.Objetivo: analizar las relaciones filogenéticas de seis cepas de Ganoderma applanatum.Para ello se extrajo ADN genómico, se amplificaron las regiones ITS con cebadores universales ITS-1 e ITS-4 y se secuenciaron los fragmentos obtenidos. Con estas secuencias se procedió a un alineamiento con el programa BioEdit. Luego se construyó una matriz que fue analizada con el programa T.N.T. Para la búsqueda del árbol mas parsimonioso se utilizó 1000 RAS guardando un árbol por TBR, el cual fue soportado por booststrap y Jackknifin de 1000 matrices remuestreadas.Se alinearon un total de 788 nucleótidos, de los que se excluyeron 232 caracteres por estar en regiones ambiguas, 361 caracteres fueron constantes, 189 variables y 154 fueron filogenéticamente informativos. Del análisis de parsimonia resultó 4 árboles de 1188 pasos, revelando que las cepas A, B, C, D y E; y las cepas F y D, forman dos clados monofiléticos.