INVESTIGADORES
SAMOLUK Sergio Sebastian
congresos y reuniones científicas
Título:
ANÁLISIS GENÓMICO COMPARATIVO DE LA FAMILIA DE GENES SRS EN Arachis hypogaea (LEGUMINOSAE)
Autor/es:
GUTIERREZ T; PEREZ G; BALLEN-TABORDA C; CHALUP L; SEIJO JG; SAMOLUK SS
Reunión:
Congreso; LI Congreso Argentino de Genética; 2023
Resumen:
La familia génica SRS codifica para un grupo de factores transcripción de plantas, que regulan procesos relacionados con el crecimiento, desarrollo y respuesta a estrés. El maní cultivado es una de las leguminosas comestibles más importantes del mundo. Actualmente, la producción nacional está comprometida debido a la susceptibilidad del cultivo a múltiples estreses. En este trabajo se realizó la caracterización global de la familia SRS en el genoma del cv. Tifrunner (PeanutBase), incluyendo inferencias filogenéticas, estructuras génicas, duplicaciones y diversidad de expresión. En total, se identificaron 28 genes de longitud y estructura variable. El análisis con Protparam-Expasy reveló que las proteínas tenían diferente peso molecular y punto isoeléctrico. Las búsquedas con HMMER revelaron la presencia de dominios IXGH y ring-like zinc finger, característicos de esta familia. El análisis comparativo de la región promotora contra la base de datos PlantCare reveló motivos relacionados con el crecimiento, desarrollo y respuestas a diferentes tipos de estrés. Los análisis filogenéticos evidenciaron 6 grupos con estructuras génicas y proteicas particulares. Resultados de BLASTp sugieren que eventos de duplicación segmentaria habrían participado en la diversificación de esta familia. Análisis de RNAseq sugieren patrones particulares de expresión en diferentes tejidos y estados del desarrollo. La caracterización estructural de estos genes constituye la base para el desarrollo de análisis funcionales de mecanismos asociados a caracteres de interés agronómico.