Estudio de diversidad genética en Candidatus Liberibacter asiaticus

BADARACCO, ALEJANDRA; REDES, FRANCO; ACUÑA, LUIS; SCHAPOVALOFF, MARIA ELENA; AGOSTINI, JUAN PEDRO

Concordia

Congreso; X Congreso Argentino de Citricultura; 2023

Huanglongbing (HLB) es una de las principales enfermedades de los cítricos y actualmente no tiene cu-ra. Se asocia con Candidatus Liberibacter spp. y varios fitoplasmas. Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) es la bacteria más prevalente y se transmite a través de Diaphorina citri. Desde 2012, se ha detectado CLas en plantas cítricas en varias provincias de Argentina. Una planta infectada con HLB tiene un largo pe-ríodo de incubación, no presentando síntomas, pero siendo posible transmitir la enfermedad. El estudio de la diversidad genética provee un marco para el entendimiento de la taxonomía, estructura y dinámica poblacional. Además, provee claves para métodos rápidos y específicos para la detección y diagnóstico del patógeno. Desde la publicación de la secuencia del genoma de CLas, un número de loci, especialmente secuencias repetitivas y regiones de profagos, han demostrado ser marcadores superiores para diferenciar cepas de diferentes regiones geográficas. El objetivo del presente trabajo se centra en estudiar la diversi-dad genética y la relación filogenética de las cepas bacterianas circulantes en nuestro país o región. Para ello, se seleccionaron 41 muestras positivas de diferentes localizaciones geográficas del país (Entre Ríos, Corrientes, Formosa y Misiones) y de diferentes años (2014 a 2020). Se realizó extracción de ADN y se am-plificó utilizando primers específicos de una región de un profago inserto en el genoma de CLas (Liu et al., 2011). Del total de muestras seleccionadas se logró amplificar para la región del fago un total de 19 mues-tras, de ellas se seleccionaron 10, que se enviaron a secuenciar. Luego, se procedió al análisis filogenético de las secuencias obtenidas en este estudio y las disponibles en la base de datos GenBank. En el árbol filo-genético se pueden observar dos grupos bien definidos. Las secuencias de CLas de Argentina se agruparon todas juntas en un mismo cluster con otras muestras de Colombia, Estados Unidos, China, Bhutan y Pakis-tán. Aún quedan por realizar estudios de diversidad genética y poblacional.