IIMYC 23581
INSTITUTO DE INVESTIGACIONES MARINAS Y COSTERAS
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Genética del paisaje del tuco tuco de las dunas (Ctenomys australis): aplicación de teledetección de alta resolución y métodos de aprendizaje de máquinas
Autor/es:
MORA, MATÍAS SEBASTIÁN; KITTLEIN, MARCELO JAVIER; MAPELLI, FERNANDO JAVIER
Lugar:
Puerto Madryn
Reunión:
Congreso; XXXII Jornadas Argentinas de Mastozoología; 2019
Institución organizadora:
Sociedad Argentina para el Estudio de los Mamíferos
Resumen:
La disponibilidad actual de información ambiental y de métodos de análisis es realmente abrumadora. Los algoritmos de aprendizaje de máquina se perfilan como una novedosa alternativa para relacionar esta información con distintas aproximaciones utilizadas en la cuantificación de la estructuración genética. En esta contribución exploramos una simple implementación de estos métodos para el estudio de la genética del paisaje del tuco-tuco de las dunas (Ctenomys australis) con el propósito de transformar información ambiental de libre disponibilidad a una resolución espacial más detallada y utilizarla para evaluar la variación de la estructuración genética desde una escala de unas pocas decenas de metros hasta 1 km. Se utilizó la información del genotipo para 8 loci de microsatélites y la posición geográfica de 114 tuco-tucos muestreados en dunas costeras, 10km al sur de Necochea, Buenos Aires, Argentina. Se calculó la diversidad genética (promedio de alelos por locus [PAL], y la heterocigosidad promedio observada y esperada [HPO y HPE, respectivamente]) en ventanas móviles de dimensiones variables; cuantificando la variación espacial de estos índices a partir de los genotipos incluidos. Deesta manera desligamos la cuantificación de la diversidad de la localidad de muestreo para evaluarla a distintas escalas. Se utilizó una red neuronal convolucional (RNC) para estimar la relación entre distintas medidas que caracterizan la estructura del paisaje (NDVI, pendiente, y conectividad de médanos) y la variación espacial de la diversidad genética expresada por los distintos índices. Se presentan y discuten las ventajas y dificultades identificadas en la utilización de estas herramientas para evaluar la relación entre los atributos del paisaje con la variación espacial de la diversidad genética a distintas escalas.Financiado por: CONICET (PIP 5844), FONCYT (PICT 201-0427), Universidad Nacional de Mar del Plata (EXA903/18).
