Análisis de genómica comparativa muestran un clado de cepas portadoras de genes con implicancia clínica en la especie ambiental A. bereziniae

BROVEDAN, MARCOS; REPIZO, GUILLERMO D.; MARCHIARO, P.; ESPARIZ, MARTIN; VIALE, ALEJANDRO M.; LIMANSKY, ADRIANA

XVIII Jornadas de Microbiologia 2018 (JAM 2018) y IX Congreso Bioquímico

Congreso; XVIII Jornadas de Microbiologia 2018 (JAM 2018) y IX Congreso Bioquímico; 2018

Filial Rosario - AAM

Acinetobacter bereziniae (Abe),especie ambiental poco asociada a infecciones nosocomiales, exhibe actualmente cepas resistentes acarbapenemes (1). Reportamos recientemente el genoma de una cepa local portadorade blaNDM-1 (1 y 2),siendo 7 los depositados al presente. Evaluamos la variabilidad genética intraespecífica,y la presencia de cepas que comparten características adaptativas. Incluimosen este estudio estos 7 genomas y 2 Acinetobacter sp (Ag2 yWC-743) identificados aquí como Abemediante "Average Nucleotide Identity" (3). El empleo de "Pan-Genomes Analysis Pipeline" (PGAP) nos permitió conocer que 70% de los genes de Abepertenecen al "core (n= 3014), mientras que 30% restante (n= ~ 1200) es accesorio. Similar análisis con A.baumannii (Aba, 4), mostró 1590genes "core", constituyendo 40% del total. La comparación del pangenoma de Abe y Aba mostró 7508 y 9513 genes, respectivamente. Estos resultadosmuestran que Abe es una especie debaja plasticidad. El análisis filogenético basado en las secuenciasconcatenadas de 1663 genes del genoma core de las cepas de Abe incluyendo cepas tipo de A. gerneri y A. guillouiae, distinguió 4 grupos: i) NIPH3; ii) XH901; iii) CIP70.12 y KCTC 23199 y iv) HPC229, CHI-40-1, 507_ABAU, WC-743 y Ag2. La evaluación de cepas que compartencaracterísticas funcionales empleando OrthoMCL(2) mostró3 grupos: i) CIP 70.12 y KCTC 23199 (aisladas en1960); ii) NIPH 3 (1991) y iii) 507_ABAU, WC-743, Ag2, CHI-40-1, HPC229 y XH901(desde 2005). El repertorio proteico mostró ausencia/presencia de genescodificantes de mecanismos de resistencia, factores de virulencia y transposones,en grupos i-ii, respecto de iii, respectivamente. Este trabajo aportaasí evidencias de la capacidad de ciertas cepas de Abe de adaptarse a hábitats nosocomiales, explicando el hallazgo deesta especie en especímenes clínicos.1-Brovedan et al,AAC, 20152-Brovedan et al, Gen Announc, 20163-Espariz et al,PLoS ONE, 20164-Touchonet al, Gen Biol Evol, 2014