Análisis comparativo de la región ITS1-5.8s-ITS4 entre cepas de Candida parapsilosis (sensu stricto) de aislados clínicos y ambientales

MADRASSI, L; ; SALVATIERRA K, ; SOSA VME, ; SEÑUK IA, ; ASKENAZI MV, ; FONSECA MI, ; VEDOYA, MC

Jornada; Jornadas Cientifico - Tecnologicas en el marco del 45° aniversario de la UNaM.; 2018

El género Cándida corresponde a un grupo de hongos levaduriformes de interés médico. El complejo Cándida parapsilosis se caracteriza por su amplia distribución en la naturaleza, y ocasionar candidiasis humanas. La especie más frecuente dentro del complejo es Cándida parapsilosis (sensu stricto) cuya identificación se realiza habitualmente mediante el estudio del fragmento TIS1-5.8S-ITS4 de ARN ribosomal. El objetivo del trabajo fue realizar una comparación de la secuencia nucleotídica de C. parapsilosis (sensu stricto) de la región TIS1-5.8S-ITS4 de cepas de aislados clínicos y de diversos ambientes naturales. Se trabajó con secuencias nucleotídicas (359 nt) de 33 cepas de aislados clínicos locales y 470 secuencias nucleotídicas obtenidas de la base de datos Internacional GenBank (390 secuencias clínicas de 14 países, y 80 secuencias ambientales de 7 países), y se incluyó la cepa C. methapsilosis ATCC96144 como grupo externo. Se utilizó el programa Mega7 para el alineamiento, edición y análisis filogenético (Neighbor joining) de las secuencias. Los resultados indicaron que 10/503 (2%) secuencias mostraron algún polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) que producen un cambio aminoacídico. Las secuencias que presentaron SNPs eran de aislados clínicos provenientes de Argentina, Australia, Estados Unidos y Reino Unido. Algunas secuencias mostraron un cambio nucleótidico, transición purínica, que produce un cambio aminoacídico I (isoleucina) por V (valina), y otras secuencias mostraron una transición pirimidínica C que produce un cambio aminoacídico V por A (alanina). Una secuencia proveniente de un aislado clínico de Brasil, muestra una inserción de un triplete de nucleótidos, que codifica el aminoácido D (aspartato). Las cepas que presentan SNPs, aparecen como subramificaciones del nodo principal, sin embargo la cepa que presenta una inserción de nucleótidos no produjo un cambio en el ordenamiento filogenético, es decir, esta cepa se agrupó al nodo principal. Ninguna cepa de aislados ambientales presentó SNP en la secuencia nucleotídica. El análisis del fragmento TIS1-5.8S-ITS4 de C. parapsilosis (sensu stricto) de aislados de muestras clínicas como ambientales formaron un único nodo en el árbol filogenético, sin observar diversidad biológica, a pesar de observar SNP en algunas secuencias analizadas.