DISEÑO DE CEBADORES ESPECÍFICOS PARA DOS CEPAS DE Bacillus altitudinis SELECCIONADAS POR SU CAPACIDAD DE PROMOCIÓN DEL CRECIMIENTO VEGETAL.

CORTESE, IJ; CASTRILLO, ML; ZAPATA, PD; LACZESKI, ME

Modalidad virtual

Congreso; XLVIII CONGRESO ARGENTINO DE GENÉTICA 2020; 2020

Las bacterias promotoras del crecimiento vegetal (PGPR) poseen importancia comercial y ambiental ya que ejercen efectos positivos sobre el crecimiento y el desarrollo de las plantas de manera directa o indirecta. Ensayos que evalúen la colonización y trazabilidad de PGPR son necesarios para su aplicación in vivo. En el presente estudio se trabajó con dos cepas de Bacillus altitudinis aisladas de plantines de Ilex paraguariensis, seleccionadas por su capacidad PGPR in vitro y en vivero. El objetivo fue diseñar cebadores específicos para B. altitudinis 19RS3 y T5S-T4 para su detección molecular en ensayos in vivo posteriores. Se compararon los genomas de ambas cepas con los genomas de Bacillus disponibles, utilizando la herramienta Seed Viewer de Rapid Annotation using Subsystem Technology. Se seleccionaron secuencias de 200-800 pb y se contrastaron en la base de datos del National Center for Biotechnology Information. Se seleccionaron las secuencias únicas y se diseñaron cebadores utilizando Primer3. Se evaluó la especificidad de los cebadores con la herramienta de simulación InSilico PCR Amplification. Se obtuvieron 2 pares de cebadores específicos para cada cepa, para 19RS3: 873F 3´-ATTggCAAAgATAgCAggg-5´, 873R 3´-AgCATCAATCggCTgTggA-5´, 884F3´-ggTCAgCCTgTAAAAACACCg-5´ y 884R3´-gTCCCATCCATTAACCTTCA-5´; y para T5S-T4: 2341F3´-ACACCACATCATTCACTggAgA-5´, 2341R 3´-gCCTTCTAACATCCTgCA-5´, 3296F 3´-gCTACATATCCAACTCCTCAgA-5´ y 3296R3´-AgCAATAgTAACCgACTTCTCAg-5´. Se diseñaron cebadores específicos para B. altitudinis 19RS3 y T5S-T4.