INVESTIGADORES
CUCHER Marcela Alejandra
congresos y reuniones científicas
Título:
Hidatidosis en la era genómica: Genoma de Echinococcus canadensis (genotipo G7).
Autor/es:
MALDONADO L; ASSIS J; GOMES ARAUJO F; OLIVEIRA G; MACCHIAROLI N; CUCHER M; ROSENZVIT M; KAMENETZKY L
Reunión:
Congreso; Congreso Panamericano de Zoonosis. VIII Congreso Argentino de Zoonosis; 2014
Resumen:
Introduccion: Echinococcus canadensis es
un parasito platelminto muy relacionado desde el punto de vista filogenético
con Echinococcus granulosus y Echinococcus multilocularis, miembros de
la clase cestode involucrados en infecciones hidatidicas en humanos y animales.
En Suramérica se han reportado tres especies: E. granulosus s.s. (genotipos G1 y G2), E. canadensis (genotipos G6 y G7) y E. ortleppi. Hasta el
momento se ha reportado limitada información genética de E. canadensis G7. El objetivo de este trabajo es secuenciar y
analizar el genoma de esta especie.
Materiales y métodos: Se extrajo ADN genómico de alta calidad de protoescolex de E. canadensis G7. Se construyeron
bibliotecas ?paired-end? y la secuenciación se realizó con la tecnología Illumina. Se evaluaron varias
metodologías usando diferentes parámetros hasta obtener el mejor ensamblado de novo mediante Velvet. Las lecturas
fueron mapeadas sobre el genoma de E.
multilocularis mediante BWA y se anotaron genes conservados utilizando
CEGMA.
Resultados: Estudios comparativos han revelado alto nivel de identidad
nucleotídica, mayor al 95%, de E.
canadensis G7, tanto con E.
multilocularis como con E. granulosus
s. s. G1. El procedimiento de anotación de genes in sílico realizado en este
trabajo permitió identificar más de un 90% de los genes altamente conservados.
Discusión: Este es el primer reporte del genoma de E. canadensis G7 obtenido mediante secuenciación paralela masiva
que permite el abordaje del estudio genómico de esta especie. El conocimiento
de la secuencia de este nuevo genoma permitirá realizar
análisis de genómica comparativa y obtener información que podría utilizarse
para la prevención diagnóstico de la hidatidosis.
Bibliografia:
Kamenetzky, L., A. M. Gutierrez, S. G. Canova, K. L.
Haag, E. A. Guarnera, A. Parra, G. E. Garcia and M. C.
Rosenzvit (2002). "Several strains of Echinococcus granulosus infect livestock
and humans in Argentina." Infect Genet Evol 2: 129-136.
Nakao M, Lavikainen A, Yanagida T, Ito A (2013) Phylogenetic systematics
of the genus Echinococcus (Cestoda:
Taeniidae). Int J Parasitol. 43:1017-29.
Tsai IJ, Zarowiecki M, Holroyd N, Garciarrubio A, Sanchez-Flores A,
Brooks KL, Tracey A, Bobes RJ, Fragoso G, Sciutto E, Aslett M, Beasley H,
Bennett HM, Cai J, Camicia F, Clark R, Cucher M, De Silva N, Day TA, Deplazes
P, Estrada K, Fernández C, Holland PW, Hou J, Hu S, Huckvale T, Hung SS,
Kamenetzky L, Keane JA, Kiss F, Koziol U, Lambert O, Liu K, Luo X, Luo Y,
Macchiaroli N, Nichol S, Paps J, Parkinson J, Pouchkina-Stantcheva N, Riddiford
N, Rosenzvit M, Salinas G, Wasmuth JD, Zamanian M, Zheng Y; Taenia solium
Genome Consortium, Cai X, Soberón X, Olson PD, Laclette JP, Brehm K, Berriman M
(2013) The genomes of four tapeworm species reveal adaptations to parasitism.
Nature. 496:57-63.
Zheng H, Zhang W, Zhang L, Zhang Z, Li J, Lu G, Zhu Y, Wang Y, Huang Y,
Liu J, Kang H, Chen J, Wang L, Chen A, Yu S, Gao Z, Jin L, Gu W, Wang Z, Zhao
L, Shi B, Wen H, Lin R, Jones MK, Brejova B, Vinar T, Zhao G, McManus DP, Chen
Z, Zhou Y, Wang S. The genome of the hydatid tapeworm Echinococcus granulosus. Nat Genet. 2013;45:1168-75.