ANÁLISIS MOLECULAR DE LA REGIÓN ITS DE HONGOS ASOCIADOS A PUDRICIÓN RADICAL EN Manihot esculenta

GONZALEZ, ROMINA D.; MARTÍNEZ, SEBASTIÁN .A; MADRASSI, LUCAS M.; ALVARENGA, ADRIANA E.

Jornada; X Jornada Científico Tecnológicas FCEQyN 2023; 2023

arbustiva tropical cultivada muy apreciada por su raíz tuberosa rica en almidón que representa una fuente vital de carbohidratos en la alimentación de muchas comunidades del mundo. En nuestro país es producida principalmente en Misiones. Sin embargo, su cultivo se ve comprometido por el efecto de plagas y enfermedades. Una de las enfermedades más relevantes es la pudrición radical de la mandioca o CRRD (del inglés, Cassava Root Rot Disease), es causada principalmente por hongos fitopatógenos y representa una amenaza importante para la seguridad alimentaria, especialmente en ambientes húmedos como el de nuestra provincia. En el contexto del cambio climático global, donde las enfermedades en los cultivos se vuelven más frecuentes y severas, en la provincia de Misiones, existe poca información sobre los microorganismos asociados a CRRD, es por esto que el objetivo de este trabajo fue la identificación molecular a nivel de género de 13 aislamientos fúngicos obtenidos a partir de raíces de mandioca con síntomas de pudrición radical. Para ello se realizó la amplificación, secuenciación y análisis de la región ITS1-5,8S-ITS2 (ITS). La extracción de ADN se realizó a partir de cultivos de micelio en medio líquido sacarosa extracto de levadura incubados a 28°C por 5 días. Se utilizó el marcador universal ITS. Los cebadores utilizados fueron ITS1, ITS5 e ITS-KYO1 como primers forward y ITS4 como primer reverse. Con las secuencias obtenidas se realizó la búsqueda de secuencias altamente similares en la base de datos del NCBI (del inglés, National Center for Biotechnology Information) mediante la herramienta BLASTn y se recuperaron 84 secuencias. Con las 97 secuencias se realizó la edición y el alineamiento múltiple mediante el algoritmo ClutalW y un análisis filogenético mediante un árbol hecho con el programa MEGAX. Las secuencias de los aislamientos fúngicos se analizaron con el método de distancias de Máxima Verosimilitud junto al modelo evolutivo de Kimura de 2 parámetros, con un bootstrap de 1000 réplicas. Con este análisis fue posible identificar a los géneros Lasiodiplodia (MER8), Fusarium (P1, 33F, 1.4A, 1.9A, 17A, M32A, M2), Clonostachys (P3 y P2) y Mucor (3.4P). Todos estos géneros son conocidos por incluir especies fitopatógenas. El género más frecuentemente identificado fue Fusarium con siete aislamientos, seguido de Clonostachys con dos. Estos resultados coinciden con la bibliografía ya que el género Fusarium es el más ampliamente reportado y es el agente etiológico de la enfermedad de la pudrición seca de la mandioca. Otro género asociado a otros tipos de pudrición en la mandioca es Lasiodiplodia, causante de la enfermedad de la pudrición negra. Estos resultados aportan conocimiento básico sobre la presencia de posibles agentes fúngicos asociados a CRRD en Misiones.