INVESTIGADORES
CHALUP Laura Maria Isabel
congresos y reuniones científicas
Título:
INFERENCIAS SOBRE LA EVOLUCIÓN DE LA HETEROCROMATINA PERICENTROMÉRICA EN Arachis
Autor/es:
SEBASTIÁN SAMOLUK; CHALUP LAURA; GERMAN ROBLEDO; GUILLERMO SEIJO
Lugar:
corrientes
Reunión:
Congreso; II REUNION ARGENTINA DE GENETICA EVOLUTIVA; 2017
Resumen:
Introducción: Las regiones heterocromáticas de los genomas eucariotas están compuestas principalmente pordiferentes familias de ADN satélite (ADNsat). Usualmente, estas secuencias muestran una elevada dinámicaevolutiva que conduce a perfiles específicos de especie, aún entre especies estrechamente relacionadas. Lasespecies diploides 2n=2x=20 incluidas en la sección Arachis (género Arachis) fueron asignadas a seis genomasdiferentes (A, B, D, F and K), cuya diferencia cariotípica más notable es la cantidad y distribución de laheterocromatina pericentromérica DAPI+. En este grupo, la familia de ADN satélite ATR-2 es el componenteprincipal de la heterocromatina pericentromérica de las especies con genomas A, F y K, pero no de aquellascon genomas D y B. Con el objetivo de inferir los cambios en la composición de estas regiones cromosómicasocurridos durante la diferenciación genómica, en este trabajo se realiza la caracterización de la familia deADNsat más abundante en el genoma de A. glandulifera (genoma D), y se analiza su distribución cromosómicaen las especies diploides A. glandulifera, A. duranensis (genoma A) y A. ipaënsis (genoma B).Materiales y Métodos: A partir de la secuenciación una biblioteca de ADN genómico de A. glanduliferaKSSc30099 (Illumina MiSeq) se realizó la identificación de novo de secuencias de ADNsat utilizando elprograma RepeatExplorer. El análisis de la distribución de las secuencias caracterizadas sobre metafasesmitóticas de las especies A. glandulifera, A. duranensis y A. ipaënsis se realizó mediante hibridación in situfluorescente (FISH).Resultados y Discusión Se identificaron tres familias de ADNsat en el genoma de A. glandulifera: Agla_CL8sat,Agla_CL39sat y Agla_CL69sat. De las tres familias, la primera fue la más representada abarcandoaproximadamente el 2,5% del genoma. Las familias restantes mostraron una abundancia muy baja y, portanto, no fueron incluidas en los análisis posteriores. La comparación de la secuencia consenso de la familiaAgla_CL8sat con secuencias depositadas en bases de datos públicas reveló un 75% de identidad con miembrosde la familia ATR-2. Experimentos de FISH revelaron que Agla_CL8sat se distribuye en la mayoría de las bandasheterocromáticas DAPI+de A. glandulifera (6 pares de bandas), mientras que por el contrario en sólo dos paresde bandas pequeñas en A. ipaënsis y en ninguna de A. duranensis. A través de la combinación del análisisbioinformático y experimentos de FISH se logró identificar la familia de ADNsat más abundante en el genomade A. glandulifera, la cual sería el componente principal de la heterocromatina pericentromérica del genomaD, pero no de los genomas A y B. El análisis de identidad evidenció que si bien Agla_CL8sat y ATR-2 pertenecena la misma superfamilia, son miembros de diferentes familias de ADNsat. El conjunto de resultados obtenidossugiere que la evolución de la heterocromatina pericentromérica en los diferentes genomas habría implicadocambios en los perfiles de de diferentes familias de ADNsat. Por lo tanto, la mera presencia deheterocromatina pericentromérica DAPI+en estos genomas no puede ser concebida como un carácterhomólogo y que, para ser considerada como tal entre taxones más o menos distantes, se requiere informaciónacerca de las secuencias que la componen.Agradecimientos: Agradecemos la colaboración de los Dres. Scott Jackson y David Bertioli del ?Center ofApplied Genetic Technologies, University of Georgia (Athens, Georgia- USA)