DISEÑO DE CEBADORES ESPECÍFICOS PARA DOS CEPAS DE BACILLUS ALTITUDINIS PROMOTORAS DEL CRECIMIENTO VEGETAL AISLADAS DE ILEX PARAGUARIENSIS

CORTESE, J.; CASTRILLO, M.; ZAPATA, P.; LACZESKI, M.

Congreso; XLVIII Congreso Argentino de Genética; 2020

SAG

La utilización de bacterias promotoras del crecimiento vegetal tiene gran importancia comercial y ambiental. Estas bacterias ejercen efectos positivos sobre el crecimiento y el desarrollo de las plantas de manera directa o indirecta. La generación de ensayos que permitan el monitoreo en la colonización y trazabilidad de estas cepas, así como la verificación de su efecto bioinoculante se presentan como una alternativa prometedora para su aplicación in vivo. Para el presente estudio se trabajó con dos cepas de Bacillus altitudinis previamente aisladas de plantines de Ilex paraguariensis (yerba mate) y seleccionadas por su capacidad de promoción del crecimiento vegetal in vitro y en ensayos en vivero. El objetivo del presente trabajo fue diseñar cebadores específicos para B. altitudinis 19RS3 y T5S-T4 que serán aplicados para la detección molecular de estas cepas en ensayos en vivero. Se compararon los genomas de ambas cepas con los genomas de Bacillus disponibles, utilizando la herramienta Seed Viewer de Rapid Annotation using Subsystem Technology. Se seleccionaron secuencias de 200-800 pb y se contrastaron en la base de datos del National Center for Biotechnology Information. Se seleccionaron las secuencias únicas y se diseñaron los cebadores utilizando Primer3. Se evaluó la especificidad de los cebadores con la herramienta de simulación InSilico PCR Amplification. Se obtuvieron 2 pares de cebadores específicos para cada cepa, para 19RS3: 873F 3´-ATTggCAAAgATAgCAggg-5´, 873R 3´-AgCATCAATCggCTgTggA-5´, 884F3´-ggTCAgCCTgTAAAAACACCg-5´ y 884R3´-gTCCCATCCATTAACCTTCA-5´; y para T5S-T4: 2341F3´-ACACCACATCATTCACTggAgA-5´, 2341R 3´-gCCTTCTAACATCCTgCA-5´, 3296F 3´-gCTACATATCCAACTCCTCAgA-5´ y 3296R3´-AgCAATAgTAACCgACTTCTCAg-5´. A partir de los genomas completos y las herramientas informáticas disponibles, se diseñaron cebadores específicos para la detección molecular de B. altitudinis 19RS3 y T5S-T4.