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La sección Arachis cuenta con 31 especies descriptas, 29 diploides silvestres (x=10 y x=9) y dos alotetraploides, entre ellas el cultígeno A. hypogaea (nv maní, amendoin, cacahuate). Las entidades diploides fueron asignadas a tres genomas diferentes, A, B y D, siendo los tetraploides AABB. Las especies con diferentes genomas poseen un fuerte aislamiento reproductivo, aunque en la meiosis los híbridos estériles forman bivalentes con alta frecuencia, indicando un alto grado de homología génica. Por otro lado, distintos marcadores moleculares demostraron ser altamente trasferibles, sugiriendo una extensa colinearidad de las secuencias codificantes entre los diferentes genomas. Considerando estos antecedentes, se ha comenzado a trabajar sobre la hipótesis de que la diferenciación genómica en Arachis está basada en los tipos y grado de representación de secuencias repetidas que poseen los genomas. En este marco se aislaron y mapearon por FISH fragmentos genómicos correspondientes a diferentes tipos de secuencias repetidas en los genomas A y B: cinco que presentan homología con retroelementos que tienen distribución dispersa en los cromosomas; una correspondiente a los IGRs de los rDNAs 45S; y una secuencia rica en AT propia de las regiones heterocromáticas constitutivas. Todas las secuencias hibridaron preferencialmente con el genoma A o B, excepto las secuencias de los IGR que hibridaron indistintamente en ambos genomas. Estos patrones de hibridación sustentan un modelo en el cual los genomas de Arachis compartirían una matriz génica con alto grado de colinearidad, embebida con secuencias repetidas particulares en cada genoma. Esta diferenciación genómica habría surgido por rápidos cambios evolutivos que determinaron, a su vez, la representatividad diferencial de las secuencias repetidas en cada tipo genómico.

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